RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM51Q9NW97 253 aa18.21■□□□□ 0.51
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP5Z1O43299 807 aa18.21■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTDNEP1O95476 244 aa18.21■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD1Q15327 319 aa18.21■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM184AQ8NB25 1140 aa18.21■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APPBP2Q92624 585 aa18.21■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa18.21■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BCL2L12Q9HB09 334 aa18.21■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBE2Q2LH0YL09 131 aa18.2■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18.2■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPATA5Q8NB90 893 aa18.2■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa18.2■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WNK3Q9BYP7 1800 aa18.2■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MBD4O95243 580 aa18.2■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT32Q14532 448 aa18.2■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC152Q4G0S7 254 aa18.2■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BARGINQ6ZT62 677 aa18.2■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBC1D10CQ8IV04 446 aa18.2■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DSCC1Q9BVC3 393 aa18.2■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NBPF3Q9H094 633 aa18.2■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUP62CLQ9H1M0 184 aa18.2■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCC12Q96J65 1359 aa18.19■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDCP20941 246 aa18.19■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADD2P35612 726 aa18.19■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LUZP1Q86V48 1076 aa18.19■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXW7Q969H0 707 aa18.19■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa18.19■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B4E1Z4 1266 aa18.19■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EVX2Q03828 476 aa18.19■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LPIN2Q92539 896 aa18.19■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSPA1LP34931 641 aa18.18■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNMDQ9H2S6 317 aa18.18■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPDC1A2A3K4 754 aa18.18■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRC1O43663 620 aa18.18■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADGRA1Q86SQ6 560 aa18.18■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC82Q8N4S0 544 aa18.18■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AIDAQ96BJ3 306 aa18.18■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF213O14771 459 aa18.18■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC5A1P13866 664 aa18.18■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANTXR2P58335 489 aa18.18■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.18■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AIFM3Q96NN9 605 aa18.18■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC192P0DO97 292 aa18.17■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGFR2P21802 821 aa18.17■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SDR42E1Q8WUS8 393 aa18.17■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRP2BPQ9P2M1 347 aa18.17■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TACC3Q9Y6A5 838 aa18.17■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A087WWV3 80 aa18.17■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa18.17■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAP3K11Q16584 847 aa18.17■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NWD2Q9ULI1 1742 aa18.17■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa18.16■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS72Q15906 364 aa18.16■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYB5R4Q7L1T6 521 aa18.16■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LCORLQ8N3X6 602 aa18.16■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPDYE4A6NLX3 237 aa18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DYNC1I1O14576 645 aa18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NR1I2O75469 434 aa18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DRC7Q8IY82 874 aa18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA8BA8MQT2 603 aa18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UVSSAQ2YD98 709 aa18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TERF1P54274 439 aa18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TYRO3Q06418 890 aa18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANO6Q4KMQ2 910 aa18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FUCA2Q9BTY2 467 aa18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAI14Q9P0K7 980 aa18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NEDD4P46934 1319 aa18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MROH5Q6ZUA9 1318 aa18.15■□□□□ 0.5
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZPR1O75312 459 aa18.14■□□□□ 0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TXNRD3Q86VQ6 643 aa18.14■□□□□ 0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MICU3Q86XE3 530 aa18.14■□□□□ 0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS37DQ86XT2 251 aa18.14■□□□□ 0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM196AQ6ZSG2 479 aa18.14■□□□□ 0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa18.14■□□□□ 0.49
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AFF2P51816 1311 aa18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms