RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485604.1

PHF20-212, Transcript of PHD finger protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene PHF20, Length 446 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20-212ENST00000485604 RIMBP2O15034 1052 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 CELF2O95319 508 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 ITGA6P23229 1130 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 ATP2B4P23634 1241 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 FOXO4P98177 505 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 DACT2Q5SW24 774 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 DLK2Q6UY11 383 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 CDC37L1Q7L3B6 337 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 TXNRD3Q86VQ6 643 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 FAM161BQ96MY7 647 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 KCNH6Q9H252 994 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 MYH16Q9H6N6 1097 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 GGA3Q9NZ52 723 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 ECM29Q5VYK3 1845 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 UTYO14607 1347 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 F6X3S4 739 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 H7C1D1 291 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 GPR25O00155 361 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 CCT4P50991 539 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 EPHA10Q5JZY3 1008 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 KRT26Q7Z3Y9 468 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 PODNQ7Z5L7 613 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 USP48Q86UV5 1035 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 KAZALD1Q96I82 304 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 ASB2Q96Q27 587 aa5.53□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PHF20-212ENST00000485604 ZNF804BA4D1E1 1349 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 MYO3BQ8WXR4 1341 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 USP17L3A6NCW0 530 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 USP17L4A6NCW7 530 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 GRM8O00222 908 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 ALDH1L1O75891 902 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 SLC10A3P09131 477 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 USP17L8P0C7I0 530 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 CHRNDQ07001 517 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 STRIP1Q5VSL9 837 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 USP17L1Q7RTZ2 530 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 CCDC102AQ96A19 550 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 CDCA5Q96FF9 252 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 FBXL18Q96ME1 805 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 HTATIP2Q9BUP3 242 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 MXD3Q9BW11 206 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 ANKRD2Q9GZV1 360 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 COA1Q9GZY4 146 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 MYOZ2Q9NPC6 264 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 LEMD3Q9Y2U8 911 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 OTOFQ9HC10 1997 aa5.52□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 E9PSI1 815 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 SNAP23O00161 211 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 TBC1D8O95759 1140 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 IL1R1P14778 569 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 MMP14P50281 582 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 HUNKP57058 714 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 FKBP1BP68106 108 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 SCARF1Q14162 830 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 RASAL3Q86YV0 1011 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 TDHQ8IZJ6 230 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 CERS5Q8N5B7 392 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 ANKRD44Q8N8A2 993 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 VGLL2Q8N8G2 317 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 XIRP2A4UGR9 3374 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 DNAH12Q6ZR08 3092 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 DNAH14Q0VDD8 3507 aa5.51□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 PTPRCP08575 1304 aa5.5□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 AOX1Q06278 1338 aa5.5□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa5.5□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 WNT10BO00744 389 aa5.5□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 FKTNO75072 461 aa5.5□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 KRT38O76015 456 aa5.5□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 SASH1O94885 1247 aa5.5□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 SLFN5Q08AF3 891 aa5.5□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 NBPF9Q3BBW0 867 aa5.5□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 RGMBQ6NW40 437 aa5.5□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 LMBR1LQ6UX01 489 aa5.5□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 SULF1Q8IWU6 871 aa5.5□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 FAM9BQ8IZU0 186 aa5.5□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 MTMR14Q8NCE2 650 aa5.5□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 SSH1Q8WYL5 1049 aa5.5□□□□□ -1.53
PHF20-212ENST00000485604 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms