RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484886.1

SNX17-206, Transcript of sorting nexin 17, humanhuman

TSL 2

Gene SNX17, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17-206ENST00000484886 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.55■■□□□ 1.36
SNX17-206ENST00000484886 APBB1O00213 710 aa23.54■■□□□ 1.36
SNX17-206ENST00000484886 GRM1Q13255 1194 aa23.54■■□□□ 1.36
SNX17-206ENST00000484886 RASGRF1Q13972 1273 aa23.54■■□□□ 1.36
SNX17-206ENST00000484886 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.54■■□□□ 1.36
SNX17-206ENST00000484886 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SNX17-206ENST00000484886 RASSF10A6NK89 507 aa23.53■■□□□ 1.36
SNX17-206ENST00000484886 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SNX17-206ENST00000484886 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.53■■□□□ 1.36
SNX17-206ENST00000484886 BCL11AQ9H165 835 aa23.53■■□□□ 1.36
SNX17-206ENST00000484886 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SNX17-206ENST00000484886 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.52■■□□□ 1.36
SNX17-206ENST00000484886 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.52■■□□□ 1.36
SNX17-206ENST00000484886 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SNX17-206ENST00000484886 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.51■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 PRDX5P30044 214 aa23.51■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 NF2P35240 595 aa23.51■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 VEGFBP49765 207 aa23.51■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.51■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.51■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.51■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 ABCF2Q9UG63 623 aa23.51■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 AOX1Q06278 1338 aa23.51■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 HUNKP57058 714 aa23.5■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 SPATA5Q8NB90 893 aa23.5■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
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SNX17-206ENST00000484886 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.5■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.49■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 AACSQ86V21 672 aa23.49■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.49■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.49■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.49■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.49■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 ECE1P42892 770 aa23.48■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 TNFAIP1Q13829 316 aa23.48■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.48■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.48■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 PI16Q6UXB8 463 aa23.48■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 JMYQ8N9B5 988 aa23.48■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 CAPNS2Q96L46 248 aa23.48■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.48■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.48■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.47■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.47■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 MRIQ9BWK5 157 aa23.47■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.46■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 ZBTB22O15209 634 aa23.46■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 RAB11FIP3O75154 756 aa23.46■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 MCAMP43121 646 aa23.46■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.46■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 CRBNQ96SW2 442 aa23.46■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 SNRKQ9NRH2 765 aa23.46■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.46■■□□□ 1.35
SNX17-206ENST00000484886 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.45■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 PRKG1Q13976 671 aa23.45■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 RASA3Q14644 834 aa23.45■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.45■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 TNNI2P48788 182 aa23.44■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 CACNB3P54284 484 aa23.44■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 FKBP1BP68106 108 aa23.44■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.44■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 SLF2Q8IX21 1173 aa23.44■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.44■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 RAI14Q9P0K7 980 aa23.44■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.43■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.43■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.42■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 RGMBQ6NW40 437 aa23.42■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 MOB2Q70IA6 237 aa23.42■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.42■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.41■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 MECOMQ03112 1051 aa23.41■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 AOC2O75106 756 aa23.4■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 GSTO1P78417 241 aa23.4■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.4■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.4■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SNX17-206ENST00000484886 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.39■■□□□ 1.33
SNX17-206ENST00000484886 USP40Q9NVE5 1235 aa23.39■■□□□ 1.33
SNX17-206ENST00000484886 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SNX17-206ENST00000484886 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.38■■□□□ 1.33
SNX17-206ENST00000484886 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SNX17-206ENST00000484886 ZAP70P43403 619 aa23.38■■□□□ 1.33
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