RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 CSF1RP07333 972 aa7.46□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 MSS51Q4VC12 460 aa7.46□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.46□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.46□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.46□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.46□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 PLA2G12BQ9BX93 195 aa7.46□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 USP26Q9BXU7 913 aa7.46□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.46□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 SCN7AQ01118 1682 aa7.46□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 C4BP0C0L5 1744 aa7.46□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 CDHR2Q9BYE9 1310 aa7.46□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.46□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 C4AP0C0L4 1744 aa7.45□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 ERC2O15083 957 aa7.45□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 TRIM37O94972 964 aa7.45□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 GGCXP38435 758 aa7.45□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 CTSWP56202 376 aa7.45□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 TIMM10P62072 90 aa7.45□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC57Q2TAC2 916 aa7.45□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.45□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.45□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.45□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.45□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 BOLA2Q9H3K6 86 aa7.45□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 LRRC4BQ9NT99 713 aa7.45□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 LAMB2P55268 1798 aa7.45□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 TTC41PQ6P2S7 1318 aa7.45□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 RIC1Q4ADV7 1423 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 C6orf229H3BNL8 230 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 SPTLC1O15269 473 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 PDE8AO60658 829 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 RPS6KA4O75676 772 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 NTSR2O95665 410 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 ITGA6P23229 1130 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 ADORA1P30542 326 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 ERFEQ4G0M1 354 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 TAF7LQ5H9L4 462 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 TBC1D9BQ66K14 1250 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 CASC1Q6TDU7 716 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 GPATCH3Q96I76 525 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 NEUROD6Q96NK8 337 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 UBR3Q6ZT12 1888 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 SH3TC1Q8TE82 1336 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF609O15014 1411 aa7.44□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa7.43□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 CIAO1O76071 339 aa7.43□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 RGS20O76081 388 aa7.43□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 CHGBP05060 677 aa7.43□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 ATP5JP18859 108 aa7.43□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 IL15P40933 162 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.43□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 CNTROBQ8N137 903 aa7.43□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.43□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.43□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 NARFQ9UHQ1 456 aa7.43□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa7.43□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 COL24A1Q17RW2 1714 aa7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 A0A1B0GUL7 405 aa7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 RAD21O60216 631 aa7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 MMP16P51512 607 aa7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 QPCTQ16769 361 aa7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 PARP10Q53GL7 1025 aa7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 RETREG3Q86VR2 466 aa7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 EVI5LQ96CN4 794 aa7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 FAM227BQ96M60 508 aa7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 SNRKQ9NRH2 765 aa7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 PALD1Q9ULE6 856 aa7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 ABCC12Q96J65 1359 aa7.42□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 LRP5O75197 1615 aa7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 A0A1B0GUL6 1792 aa7.41□□□□□ -1.22
SKAP2-204ENST00000481204 A0A0D9SFI3 127 aa7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 255 ms