RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
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C9orf3-215ENST00000478473 SSC5DA1L4H1 1573 aa29.07■■■□□ 2.24
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C9orf3-215ENST00000478473 UBE2Q2LH0YL09 131 aa29.07■■■□□ 2.24
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C9orf3-215ENST00000478473 TNS4Q8IZW8 715 aa29.07■■■□□ 2.24
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C9orf3-215ENST00000478473 ADORA1P30542 326 aa29.02■■■□□ 2.24
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C9orf3-215ENST00000478473 FZD1Q9UP38 647 aa28.94■■■□□ 2.22
C9orf3-215ENST00000478473 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa28.94■■■□□ 2.22
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C9orf3-215ENST00000478473 C1orf115Q9H7X2 142 aa28.92■■■□□ 2.22
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C9orf3-215ENST00000478473 DIXDC1Q155Q3 683 aa28.91■■■□□ 2.22
C9orf3-215ENST00000478473 CEP85Q6P2H3 762 aa28.91■■■□□ 2.22
C9orf3-215ENST00000478473 SLC10A4Q96EP9 437 aa28.91■■■□□ 2.22
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C9orf3-215ENST00000478473 NEUROD6Q96NK8 337 aa28.9■■■□□ 2.22
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C9orf3-215ENST00000478473 SURF6O75683 361 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
C9orf3-215ENST00000478473 TRPA1O75762 1119 aa28.89■■■□□ 2.22
C9orf3-215ENST00000478473 CACNB3P54284 484 aa28.89■■■□□ 2.22
C9orf3-215ENST00000478473 SREBF2Q12772 1141 aa28.89■■■□□ 2.22
C9orf3-215ENST00000478473 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
C9orf3-215ENST00000478473 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa28.89■■■□□ 2.22
C9orf3-215ENST00000478473 HMG20BQ9P0W2 317 aa28.89■■■□□ 2.22
C9orf3-215ENST00000478473 INHBEP58166 350 aa28.88■■■□□ 2.21
C9orf3-215ENST00000478473 TNNI3KQ59H18 835 aa28.88■■■□□ 2.21
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