RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa16.46■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 SALL1Q9NSC2 1324 aa16.45■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.45■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 F8W031 263 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 SPDYE6P0CI01 402 aa16.45■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 TNFAIP1Q13829 316 aa16.45■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 CFAP100Q494V2 611 aa16.45■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 GORABQ5T7V8 394 aa16.45■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 CCDC102BQ68D86 513 aa16.45■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 TIMM10P62072 90 aa16.44■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 TEKT1Q969V4 418 aa16.44■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 XAGE2Q96GT9 111 aa16.44■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 NEUROD6Q96NK8 337 aa16.44■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.44■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 ZNF408Q9H9D4 720 aa16.44■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 ADM5C9JUS6 153 aa16.43■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 IGSF3O75054 1194 aa16.43■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 GRM1Q13255 1194 aa16.43■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 HHIPL2Q6UWX4 724 aa16.43■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 CDCA5Q96FF9 252 aa16.43■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 JAG2Q9Y219 1238 aa16.43■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa16.42■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 PHKA1P46020 1223 aa16.42■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 CRKP46108 304 aa16.42■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 CCDC158Q5M9N0 1113 aa16.42■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 SLF2Q8IX21 1173 aa16.42■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 AOC2O75106 756 aa16.41■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 LDHBP07195 334 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 TNNI2P48788 182 aa16.41■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 TNNI3KQ59H18 835 aa16.41■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 ZDHHC15Q96MV8 337 aa16.41■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa16.41■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa16.41■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 CA12O43570 354 aa16.4■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 HUNKP57058 714 aa16.4■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa16.4■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 FKBP1CQ5VVH2 108 aa16.4■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 CCDC102AQ96A19 550 aa16.4■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 DEFB129Q9H1M3 183 aa16.4■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 TMOD2Q9NZR1 351 aa16.4■□□□□ 0.22
PRAME-211ENST00000476336 UNCXA6NJT0 531 aa16.39■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 RAB11FIP3O75154 756 aa16.39■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 ADORA1P30542 326 aa16.39■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 RASGRF1Q13972 1273 aa16.39■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.39■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 ARMC9Q7Z3E5 817 aa16.38■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 SPATA5Q8NB90 893 aa16.38■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 HOOK2Q96ED9 719 aa16.38■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 KIF1BPQ96EK5 621 aa16.38■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 VEZTQ9HBM0 779 aa16.38■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa16.38■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 RRP1P56182 461 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 NOGQ13253 232 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 AAMPQ13685 434 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 TTC39AQ5SRH9 613 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 RGMBQ6NW40 437 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 ABHD8Q96I13 439 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 CLRN2A0PK11 232 aa16.36■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 GSTO1P78417 241 aa16.36■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.36■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 DLK2Q6UY11 383 aa16.36■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 ERICH6Q7L0X2 663 aa16.36■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 FAM83AQ86UY5 434 aa16.36■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 ABCF2Q9UG63 623 aa16.36■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 MYH2Q9UKX2 1941 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 LDHCP07864 332 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 PRDX5P30044 214 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 RASA3Q14644 834 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 GRIK5Q16478 980 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 RHPN1Q8TCX5 695 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 HMG20BQ9P0W2 317 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 MAP3K11Q16584 847 aa16.34■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 TSKSQ9UJT2 592 aa16.34■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa16.34■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 AKAP11Q9UKA4 1901 aa16.33■□□□□ 0.21
PRAME-211ENST00000476336 MCAMP43121 646 aa16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms