RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472446.1

PEMT-208, Transcript of phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, human

TSL 3

Gene PEMT, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PEMT-208	ENST00000472446	EFCC1	Q9HA90	598 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	CSAD	Q9Y600	493 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	MAP3K9	P80192	1104 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	METTL24	Q5JXM2	366 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	LAMB1	P07942	1786 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	GTF2A2	P52657	109 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	TEKT1	Q969V4	418 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	KAZALD1	Q96I82	304 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	PTPN18	Q99952	460 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	UTY	O14607	1347 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	GCC1	Q96CN9	775 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	TEPSIN	Q96N21	525 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PEMT-208	ENST00000472446	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	CCL15	Q16663	113 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	HOOK2	Q96ED9	719 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	PDE8B	O95263	885 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	VGLL4	Q14135	290 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	LRRC24	Q50LG9	513 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	OTOF	Q9HC10	1997 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	MAST3	O60307	1309 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	29.18	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	OTUD5	Q96G74	571 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	29.17	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	PTPRC	P08575	1304 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	POTEF	A5A3E0	1075 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	MRI	Q9BWK5	157 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	NBPF11	Q86T75	865 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	BCAM	P50895	628 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	GRIK5	Q16478	980 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	ARMC5	Q96C12	935 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PEMT-208	ENST00000472446	CETP	P11597	493 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	CACNB3	P54284	484 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	DCAF15	Q66K64	600 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	FAM83A	Q86UY5	434 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	ERO1B	Q86YB8	467 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	WRNIP1	Q96S55	665 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	KIF22	Q14807	665 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	KIF16B	Q96L93	1317 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	SLC5A1	P13866	664 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	SNAPC2	Q13487	334 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PEMT-208	ENST00000472446		E9PSI1	815 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PEMT-208	ENST00000472446	EYA2	O00167	538 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PEMT-208	ENST00000472446	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
PEMT-208	ENST00000472446	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PEMT-208	ENST00000472446	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
PEMT-208	ENST00000472446	LPIN2	Q92539	896 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PEMT-208	ENST00000472446	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
PEMT-208	ENST00000472446	USP44	Q9H0E7	712 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PEMT-208	ENST00000472446	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PEMT-208	ENST00000472446	ZNF521	Q96K83	1311 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PEMT-208	ENST00000472446	TLR2	O60603	784 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PEMT-208	ENST00000472446	FGFR2	P21802	821 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PEMT-208	ENST00000472446	PPIL2	Q13356	520 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PEMT-208	ENST00000472446	ZNF333	Q96JL9	665 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PEMT-208	ENST00000472446	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PEMT-208	ENST00000472446	IRF6	O14896	467 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PEMT-208	ENST00000472446	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PEMT-208	ENST00000472446	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24

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