RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	ATP8B2	P98198	1209 aa		18.29	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		18.29	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	BCL11A	Q9H165	835 aa		18.29	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		18.29	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC102B	Q68D86	513 aa		18.28	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	RGMB	Q6NW40	437 aa		18.28	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	MOB2	Q70IA6	237 aa		18.28	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		18.28	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	TEKT1	Q969V4	418 aa		18.28	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	XAGE2	Q96GT9	111 aa		18.28	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	MAST3	O60307	1309 aa		18.27	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		18.27	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		18.27	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		18.27	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		18.27	■□□□□ 0.52
SSR4-208	ENST00000471880	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		18.27	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		18.26	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		18.26	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		18.26	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		18.26	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	OTOF	Q9HC10	1997 aa		18.26	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	POLA2	Q14181	598 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	SSH3	Q8TE77	659 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	ABCF2	Q9UG63	623 aa		18.25	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	SEMA3E	O15041	775 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	TNNI2	P48788	182 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	CACNB3	P54284	484 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FKBP1B	P68106	108 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	TNFAIP1	Q13829	316 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	RASA3	Q14644	834 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	CEP85	Q6P2H3	762 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC102A	Q96A19	550 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FZD1	Q9UP38	647 aa		18.24	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	APBB1	O00213	710 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	PRDX5	P30044	214 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	MAP2K2	P36507	400 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	NOG	Q13253	232 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	RASGRF1	Q13972	1273 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		18.23	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	TSKS	Q9UJT2	592 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		18.22	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	LBX1	P52954	281 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	TNNI3K	Q59H18	835 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	IFFO2	Q5TF58	517 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SSR4-208	ENST00000471880	LAMB1	P07942	1786 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	HMMR	O75330	724 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	SLC10A3	P09131	477 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	PI16	Q6UXB8	463 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	SPATA5	Q8NB90	893 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	PDE3A	Q14432	1141 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	SNRK	Q9NRH2	765 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	RAI14	Q9P0K7	980 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SSR4-208	ENST00000471880	TCP10	Q12799	353 aa		18.17	■□□□□ 0.5

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