RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469744.1

MRPL28-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MRPL28, Length 1,467 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28-208ENST00000469744 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.73■■□□□ 1.07
MRPL28-208ENST00000469744 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.73■■□□□ 1.07
MRPL28-208ENST00000469744 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.72■■□□□ 1.07
MRPL28-208ENST00000469744 IGHDP01880 384 aa21.72■■□□□ 1.07
MRPL28-208ENST00000469744 NOGQ13253 232 aa21.72■■□□□ 1.07
MRPL28-208ENST00000469744 PRKG1Q13976 671 aa21.72■■□□□ 1.07
MRPL28-208ENST00000469744 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
MRPL28-208ENST00000469744 LPIN2Q92539 896 aa21.72■■□□□ 1.07
MRPL28-208ENST00000469744 SRGAP3O43295 1099 aa21.71■■□□□ 1.07
MRPL28-208ENST00000469744 ATP2B3Q16720 1220 aa21.71■■□□□ 1.07
MRPL28-208ENST00000469744 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.71■■□□□ 1.07
MRPL28-208ENST00000469744 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
MRPL28-208ENST00000469744 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
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MRPL28-208ENST00000469744 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.71■■□□□ 1.07
MRPL28-208ENST00000469744 MYO1BO43795 1136 aa21.71■■□□□ 1.07
MRPL28-208ENST00000469744 COPRSQ9NQ92 184 aa21.71■■□□□ 1.07
MRPL28-208ENST00000469744 FBXO3Q9UK99 471 aa21.71■■□□□ 1.07
MRPL28-208ENST00000469744 FZD1Q9UP38 647 aa21.71■■□□□ 1.07
MRPL28-208ENST00000469744 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
MRPL28-208ENST00000469744 SLC10A3P09131 477 aa21.7■■□□□ 1.06
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MRPL28-208ENST00000469744 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
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MRPL28-208ENST00000469744 CCDC102AQ96A19 550 aa21.7■■□□□ 1.06
MRPL28-208ENST00000469744 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.7■■□□□ 1.06
MRPL28-208ENST00000469744 GNAI2P04899 355 aa21.69■■□□□ 1.06
MRPL28-208ENST00000469744 CRKP46108 304 aa21.69■■□□□ 1.06
MRPL28-208ENST00000469744 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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MRPL28-208ENST00000469744 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.69■■□□□ 1.06
MRPL28-208ENST00000469744 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.69■■□□□ 1.06
MRPL28-208ENST00000469744 MTX1Q13505 466 aa21.68■■□□□ 1.06
MRPL28-208ENST00000469744 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.68■■□□□ 1.06
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MRPL28-208ENST00000469744 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.68■■□□□ 1.06
MRPL28-208ENST00000469744 ADORA1P30542 326 aa21.67■■□□□ 1.06
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MRPL28-208ENST00000469744 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
MRPL28-208ENST00000469744 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.66■■□□□ 1.06
MRPL28-208ENST00000469744 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
MRPL28-208ENST00000469744 CAPN15O75808 1086 aa21.65■■□□□ 1.06
MRPL28-208ENST00000469744 PHKA1P46020 1223 aa21.65■■□□□ 1.06
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MRPL28-208ENST00000469744 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
MRPL28-208ENST00000469744 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.65■■□□□ 1.06
MRPL28-208ENST00000469744 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.65■■□□□ 1.06
MRPL28-208ENST00000469744 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.65■■□□□ 1.06
MRPL28-208ENST00000469744 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
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MRPL28-208ENST00000469744 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.64■■□□□ 1.05
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MRPL28-208ENST00000469744 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.63■■□□□ 1.05
MRPL28-208ENST00000469744 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.63■■□□□ 1.05
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MRPL28-208ENST00000469744 CA12O43570 354 aa21.62■■□□□ 1.05
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MRPL28-208ENST00000469744 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
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MRPL28-208ENST00000469744 PRDX5P30044 214 aa21.6■■□□□ 1.05
MRPL28-208ENST00000469744 TNFAIP1Q13829 316 aa21.6■■□□□ 1.05
MRPL28-208ENST00000469744 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.6■■□□□ 1.05
MRPL28-208ENST00000469744 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.6■■□□□ 1.05
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MRPL28-208ENST00000469744 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.59■■□□□ 1.05
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MRPL28-208ENST00000469744 SKAP1Q86WV1 359 aa21.59■■□□□ 1.05
MRPL28-208ENST00000469744 XAGE2Q96GT9 111 aa21.59■■□□□ 1.05
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MRPL28-208ENST00000469744 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
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MRPL28-208ENST00000469744 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL28-208ENST00000469744 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
MRPL28-208ENST00000469744 TEPSINQ96N21 525 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL28-208ENST00000469744 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL28-208ENST00000469744 RNF186Q9NXI6 227 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL28-208ENST00000469744 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL28-208ENST00000469744 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.58■■□□□ 1.05
MRPL28-208ENST00000469744 POLA2Q14181 598 aa21.58■■□□□ 1.04
MRPL28-208ENST00000469744 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
MRPL28-208ENST00000469744 SEMA3EO15041 775 aa21.57■■□□□ 1.04
MRPL28-208ENST00000469744 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
MRPL28-208ENST00000469744 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
MRPL28-208ENST00000469744 TNNI2P48788 182 aa21.56■■□□□ 1.04
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