RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	AACS	Q86V21	672 aa		21.8	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		21.8	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		21.8	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	21.8	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	RAB11FIP3	O75154	756 aa		21.79	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	21.79	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	CRK	P46108	304 aa		21.79	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	21.79	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	21.79	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	ABCF2	Q9UG63	623 aa		21.79	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		21.79	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		21.79	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	MAST3	O60307	1309 aa		21.79	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		21.79	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		21.78	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	21.78	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		21.78	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	SPDYE6	P0CI01	402 aa		21.78	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	21.78	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	21.78	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		21.78	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	TEKT1	Q969V4	418 aa		21.78	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	CLRN2	A0PK11	232 aa		21.77	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	21.77	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	SPATA5	Q8NB90	893 aa		21.77	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	21.77	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	VEZT	Q9HBM0	779 aa		21.77	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	21.77	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		21.77	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	21.77	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		21.77	■■□□□ 1.08
USP19-210	ENST00000465902	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		21.76	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	21.76	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	PRDX5	P30044	214 aa		21.76	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	PI16	Q6UXB8	463 aa		21.76	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	21.76	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	SNRK	Q9NRH2	765 aa		21.76	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		21.76	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	21.75	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	21.75	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	21.75	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	CDCA5	Q96FF9	252 aa		21.75	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	21.75	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	21.75	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		21.75	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	MCAM	P43121	646 aa		21.74	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		21.74	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	21.74	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		21.74	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		21.74	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	21.74	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		21.73	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		21.73	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		21.73	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		21.73	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	AOX1	Q06278	1338 aa		21.73	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB22	O15209	634 aa		21.72	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	21.72	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		21.72	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		21.72	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	WBP1L	Q9NX94	342 aa		21.72	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	21.72	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	21.71	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	ECE1	P42892	770 aa		21.71	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	21.71	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		21.71	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		21.71	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		21.71	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	CAPNS2	Q96L46	248 aa		21.71	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	MRI	Q9BWK5	157 aa		21.71	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		21.71	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	DCTPP1	Q9H773	170 aa		21.71	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	RAI14	Q9P0K7	980 aa		21.71	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		21.71	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	21.71	■■□□□ 1.07
USP19-210	ENST00000465902	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		21.7	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		21.7	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	SLF2	Q8IX21	1173 aa		21.7	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	21.7	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	21.7	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		21.7	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	AK9	Q5TCS8	1911 aa		21.7	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		21.69	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	FOXN1	O15353	648 aa		21.69	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	NF2	P35240	595 aa		21.69	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	ZAP70	P43403	619 aa		21.69	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	GRM1	Q13255	1194 aa		21.69	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	AAMP	Q13685	434 aa		21.69	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	21.69	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		21.69	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	CACNB3	P54284	484 aa		21.68	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	21.68	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	MECOM	Q03112	1051 aa		21.68	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	TNFAIP1	Q13829	316 aa		21.68	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	21.68	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	TNNI2	P48788	182 aa		21.67	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	HUNK	P57058	714 aa		21.67	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	RASA3	Q14644	834 aa		21.67	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	AIDA	Q96BJ3	306 aa		21.67	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	21.67	■■□□□ 1.06

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