RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465292.5

KCNS3-204, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, humanhuman

TSL 4

Gene KCNS3, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3-204ENST00000465292 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
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KCNS3-204ENST00000465292 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa27.01■■□□□ 1.91
KCNS3-204ENST00000465292 SPDYE2Q495Y8 402 aa27.01■■□□□ 1.91
KCNS3-204ENST00000465292 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
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KCNS3-204ENST00000465292 ZDHHC15Q96MV8 337 aa26.93■■□□□ 1.9
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KCNS3-204ENST00000465292 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.92■■□□□ 1.9
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KCNS3-204ENST00000465292 DIXDC1Q155Q3 683 aa26.87■■□□□ 1.89
KCNS3-204ENST00000465292 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.87■■□□□ 1.89
KCNS3-204ENST00000465292 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa26.87■■□□□ 1.89
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KCNS3-204ENST00000465292 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
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KCNS3-204ENST00000465292 RASGRF1Q13972 1273 aa26.84■■□□□ 1.89
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KCNS3-204ENST00000465292 SALL1Q9NSC2 1324 aa26.84■■□□□ 1.89
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KCNS3-204ENST00000465292 ATP8B2P98198 1209 aa26.83■■□□□ 1.89
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KCNS3-204ENST00000465292 FKBP1CQ5VVH2 108 aa26.83■■□□□ 1.89
KCNS3-204ENST00000465292 FAM83AQ86UY5 434 aa26.83■■□□□ 1.89
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KCNS3-204ENST00000465292 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
KCNS3-204ENST00000465292 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.81■■□□□ 1.88
KCNS3-204ENST00000465292 GJA5P36382 358 aa26.81■■□□□ 1.88
KCNS3-204ENST00000465292 MAP3K9P80192 1104 aa26.81■■□□□ 1.88
KCNS3-204ENST00000465292 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
KCNS3-204ENST00000465292 USP40Q9NVE5 1235 aa26.81■■□□□ 1.88
KCNS3-204ENST00000465292 ZBTB22O15209 634 aa26.8■■□□□ 1.88
KCNS3-204ENST00000465292 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
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