RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CEP170-209	ENST00000464936	KIF1B	O60333	1816 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CEP170-209	ENST00000464936	ALB	P02768	609 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CEP170-209	ENST00000464936	SEC13	P55735	322 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CEP170-209	ENST00000464936	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CEP170-209	ENST00000464936	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CEP170-209	ENST00000464936	XP32	Q5T750	250 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CEP170-209	ENST00000464936	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CEP170-209	ENST00000464936	SIX5	Q8N196	739 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CEP170-209	ENST00000464936	PNMA5	Q96PV4	448 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CEP170-209	ENST00000464936	SPON1	Q9HCB6	807 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CEP170-209	ENST00000464936	SBNO1	A3KN83	1393 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	DISP2	A7MBM2	1401 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	ADGRB2	O60241	1585 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	KIF1A	Q12756	1690 aa		6.65	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	TYRO3	Q06418	890 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936		M0R2N6	131 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	C21orf2	O43822	256 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	PDE3B	Q13370	1112 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	6.63	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	GRIK4	Q16099	956 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	RGL3	Q3MIN7	710 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	NUDT8	Q8WV74	236 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	ABCC11	Q96J66	1382 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	PPL	O60437	1756 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	TECPR2	O15040	1411 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	KCNQ2	O43526	872 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	DPYD	Q12882	1025 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	TNFRSF25	Q93038	417 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	POGK	Q9P215	609 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	FAM196B	A6NMK8	535 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	LILRB5	O75023	590 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	EVA1C	P58658	441 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936		Q8N3U1	123 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	USP35	Q9P2H5	1018 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	IFT172	Q9UG01	1749 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	CARNS1	A5YM72	827 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	NFKB1	P19838	968 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	HIF1A	Q16665	826 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	PRAM1	Q96QH2	718 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	DKK1	O94907	266 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	KCNQ4	P56696	695 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	CHRNA2	Q15822	529 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	NACC1	Q96RE7	527 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	MDFI	Q99750	246 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	KLK14	Q9P0G3	267 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
CEP170-209	ENST00000464936	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	USP17L15	C9J2P7	530 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	USP17L10	C9JJH3	530 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	USP17L12	C9JPN9	530 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	USP17L11	C9JVI0	530 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	USP17L21	D6R901	530 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	USP17L18	D6R9N7	530 aa		6.58	□□□□□ -1.36

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