RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.2■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 ABCF2Q9UG63 623 aa25.2■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.2■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 APBB1O00213 710 aa25.19■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 TNNI2P48788 182 aa25.19■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.19■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 CRBNQ96SW2 442 aa25.19■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.19■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 GSTO1P78417 241 aa25.18■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.18■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.18■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 LDHCP07864 332 aa25.17■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.17■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 VEZTQ9HBM0 779 aa25.17■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 ADM5C9JUS6 153 aa25.16■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 FKBP1BP68106 108 aa25.16■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.16■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.16■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.16■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.16■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 ECE1P42892 770 aa25.15■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 KLRG1Q96E93 195 aa25.15■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 CDCA5Q96FF9 252 aa25.15■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 DCTPP1Q9H773 170 aa25.15■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 CST9Q5W186 159 aa25.14■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.14■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
IMP4-209ENST00000462357 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.13■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.13■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 BCL11AQ9H165 835 aa25.13■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 RAI14Q9P0K7 980 aa25.13■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.13■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 CLRN2A0PK11 232 aa25.12■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 PRDX5P30044 214 aa25.12■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 HTRA3P83110 453 aa25.12■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 HOOK2Q96ED9 719 aa25.12■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 GPATCH3Q96I76 525 aa25.12■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 RASSF10A6NK89 507 aa25.11■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 MCAMP43121 646 aa25.11■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.11■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.11■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 GRIK5Q16478 980 aa25.1■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.1■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.1■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.1■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 HUNKP57058 714 aa25.09■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 GCC1Q96CN9 775 aa25.09■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 RASA3Q14644 834 aa25.08■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 SNRKQ9NRH2 765 aa25.08■■□□□ 1.61
IMP4-209ENST00000462357 CNTNAP1P78357 1384 aa25.07■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 BAG3O95817 575 aa25.07■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 FAM83AQ86UY5 434 aa25.07■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 CCDC102AQ96A19 550 aa25.07■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 USP40Q9NVE5 1235 aa25.07■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25.07■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.07■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.06■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.06■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 MECOMQ03112 1051 aa25.06■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 MAP3K12Q12852 859 aa25.06■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.06■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.06■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 ZAP70P43403 619 aa25.05■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 PI16Q6UXB8 463 aa25.05■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 CERS3Q8IU89 383 aa25.05■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 UNCXA6NJT0 531 aa25.04■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 PLCG2P16885 1265 aa25.04■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
IMP4-209ENST00000462357 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms