RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460605.1

GTPBP1-204, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-204	ENST00000460605	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GTPBP1-204	ENST00000460605	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	TAF5L	O75529	589 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	GJB1	P08034	283 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	GJA8	P48165	433 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	UBXN2A	P68543	259 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	GRK4	P32298	578 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	LINS1	Q8NG48	757 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	OTOF	Q9HC10	1997 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	SLC4A2	P04920	1241 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	PSMC4	P43686	418 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	PPIL2	Q13356	520 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	RNF208	Q9H0X6	261 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605		A0A0C4DFX4	3053 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	APAF1	O14727	1248 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	CASP7	P55210	303 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	COL6A3	P12111	3177 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	SNAP23	O00161	211 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	IRF6	O14896	467 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	CCL5	P13501	91 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	CRK	P46108	304 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	PPAT	Q06203	517 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	UBE4A	Q14139	1066 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	MTFR1	Q15390	333 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	PRO3102	Q9H379	93 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	JAG2	Q9Y219	1238 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	AOX1	Q06278	1338 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	PLIN1	O60240	522 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	EVI5	O60447	810 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	FLII	Q13045	1269 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	FAM83A	Q86UY5	434 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	VPS37D	Q86XT2	251 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	OSBP	P22059	807 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	FCGRT	P55899	365 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	GPR153	Q6NV75	609 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-204	ENST00000460605	MAST3	O60307	1309 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-204	ENST00000460605	PDHX	O00330	501 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-204	ENST00000460605	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-204	ENST00000460605	SGPL1	O95470	568 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-204	ENST00000460605	FOXO4	P98177	505 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-204	ENST00000460605	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-204	ENST00000460605	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-204	ENST00000460605	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-204	ENST00000460605	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-204	ENST00000460605	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-204	ENST00000460605	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-204	ENST00000460605	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-204	ENST00000460605	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-204	ENST00000460605	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-204	ENST00000460605	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-204	ENST00000460605	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-204	ENST00000460605	GYG1	P46976	350 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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