RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 ANO6Q4KMQ2 910 aa18.32■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 AIDAQ96BJ3 306 aa18.32■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.31■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF532Q9HCE3 1301 aa18.31■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 LIFRP42702 1097 aa18.31■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 CAMK4Q16566 473 aa18.31■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 SPATA5Q8NB90 893 aa18.31■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 NACAP1Q9BZK3 213 aa18.31■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 KRT23Q9C075 422 aa18.31■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 ANO10Q9NW15 660 aa18.31■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 IDH1O75874 414 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 FDPSP14324 419 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF165P49910 485 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 RCAN1P53805 252 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 TPRNQ4KMQ1 711 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 CLEC4GQ6UXB4 293 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 BARGINQ6ZT62 677 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 SGMS1Q86VZ5 419 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 WASF1Q92558 559 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 PRIMPOLQ96LW4 560 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 USP28Q96RU2 1077 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 CBX8Q9HC52 389 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 SPTLC3Q9NUV7 552 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 TIAM2Q8IVF5 1701 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 ME1P48163 572 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 ANTXR2P58335 489 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 HAND2P61296 217 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 SARM1Q6SZW1 724 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 TMTC2Q8N394 836 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 HPS5Q9UPZ3 1129 aa18.3■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 NID2Q14112 1375 aa18.29■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 PHLPP1O60346 1717 aa18.29■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 STK36Q9NRP7 1315 aa18.29■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 RRP9O43818 475 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 APPP05067 770 aa18.29■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 PHKA1P46020 1223 aa18.29■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.29■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP18.29■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 CKAP2LQ8IYA6 745 aa18.29■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 JMYQ8N9B5 988 aa18.29■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 ENGASEQ8NFI3 743 aa18.29■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 C4AP0C0L4 1744 aa18.29■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 C4BP0C0L5 1744 aa18.29■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 NEMFO60524 1076 aa18.28■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 ATP6V1AP38606 617 aa18.28■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 SART3Q15020 963 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 STK38Q15208 465 aa18.28■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 SUSD4Q5VX71 490 aa18.28■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 CHST3Q7LGC8 479 aa18.28■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 SYNE4Q8N205 404 aa18.28■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 LINC00301Q8NCQ3 95 aa18.28■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa18.27■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 A0A0G2JLW4 131 aa18.27■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 IGSF3O75054 1194 aa18.27■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 CAMTA2O94983 1202 aa18.27■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 CRKLP46109 303 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 SIK1P57059 783 aa18.27■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 PLCB2Q00722 1185 aa18.27■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 PPP2R5BQ15173 497 aa18.27■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 PLA2G4DQ86XP0 818 aa18.27■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 FSIP1Q8NA03 581 aa18.27■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 MAP7D2Q96T17 732 aa18.27■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 NAPBQ9H115 298 aa18.27■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SUCLG2-202ENST00000460567 DYNC1I1O14576 645 aa18.26■□□□□ 0.51
SUCLG2-202ENST00000460567 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SUCLG2-202ENST00000460567 TRIM29Q14134 588 aa18.26■□□□□ 0.51
SUCLG2-202ENST00000460567 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SUCLG2-202ENST00000460567 MYSM1Q5VVJ2 828 aa18.26■□□□□ 0.51
SUCLG2-202ENST00000460567 PI16Q6UXB8 463 aa18.26■□□□□ 0.51
SUCLG2-202ENST00000460567 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SUCLG2-202ENST00000460567 SPTLC2O15270 562 aa18.25■□□□□ 0.51
SUCLG2-202ENST00000460567 ZBTB43O43298 467 aa18.25■□□□□ 0.51
SUCLG2-202ENST00000460567 DTNBO60941 627 aa18.25■□□□□ 0.51
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF75DP51815 510 aa18.25■□□□□ 0.51
SUCLG2-202ENST00000460567 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SUCLG2-202ENST00000460567 CEP57L1Q8IYX8 460 aa18.25■□□□□ 0.51
SUCLG2-202ENST00000460567 IFNL3Q8IZI9 196 aa18.25■□□□□ 0.51
SUCLG2-202ENST00000460567 TIGD1Q96MW7 591 aa18.25■□□□□ 0.51
SUCLG2-202ENST00000460567 BPIFA3Q9BQP9 254 aa18.25■□□□□ 0.51
SUCLG2-202ENST00000460567 BCORQ6W2J9 1755 aa18.25■□□□□ 0.51
SUCLG2-202ENST00000460567 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms