RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456423.1

CLDN16-202, Transcript of claudin 16, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN16, Length 430 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16-202ENST00000456423 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 PDE8BO95263 885 aa14.68□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 IFNL1Q8IU54 200 aa14.68□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.68□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 ELP3Q9H9T3 547 aa14.68□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 SMC4Q9NTJ3 1288 aa14.68□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 FKTNO75072 461 aa14.67□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 LAMB1P07942 1786 aa14.67□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 FGFR2P21802 821 aa14.66□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.66□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 PTPN18Q99952 460 aa14.66□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.66□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 SIL1Q9H173 461 aa14.66□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 TNFAIP1Q13829 316 aa14.65□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.65□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.65□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.65□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 OPTNQ96CV9 577 aa14.65□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLDN16-202ENST00000456423 EYA2O00167 538 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 CAP1Q01518 475 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 CRHR2Q13324 411 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 TEKT1Q969V4 418 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.64□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 ALDH1A1P00352 501 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 INHBEP58166 350 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 VGLL4Q14135 290 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 TRIM17Q9Y577 477 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 SLC5A1P13866 664 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 TNNI2P48788 182 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 UNCXA6NJT0 531 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 MAP3K9P80192 1104 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 LPIN2Q92539 896 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 OTUD5Q96G74 571 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 MEIS3Q99687 375 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 HTTP42858 3142 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 KIF16BQ96L93 1317 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 PRDX5P30044 214 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 ADORA1P30542 326 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 CCL15Q16663 113 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 ATP2B3Q16720 1220 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 WRNIP1Q96S55 665 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 TNNQ9UQP3 1299 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 CSADQ9Y600 493 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN16-202ENST00000456423 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 PHKA1P46020 1223 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 TCP10Q12799 353 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 NFIAQ12857 509 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 MAST3O60307 1309 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 CIAO1O76071 339 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 FAM83AQ86UY5 434 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 MRIQ9BWK5 157 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 CENPFP49454 3210 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 POTEFA5A3E0 1075 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN16-202ENST00000456423 IRF6O14896 467 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms