RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451506.5

PTPRN-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 466 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-209ENST00000451506 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 POTEFA5A3E0 1075 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 CAP1Q01518 475 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 GRIK5Q16478 980 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 UTYO14607 1347 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 CRKP46108 304 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 SP3Q02447 781 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 ARMC5Q96C12 935 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 EFCC1Q9HA90 598 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 VGLL4Q14135 290 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 TNNI2P48788 182 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 MAP3K9P80192 1104 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 ANP32CO43423 234 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 LRRC24Q50LG9 513 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 GTF2A2P52657 109 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 CCL15Q16663 113 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 VPS37DQ86XT2 251 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 CENPFP49454 3210 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 PDE8BO95263 885 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 METTL24Q5JXM2 366 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 CSADQ9Y600 493 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRN-209ENST00000451506 CACNB3P54284 484 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 TEKT1Q969V4 418 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 GCC1Q96CN9 775 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 OTUD5Q96G74 571 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 MRIQ9BWK5 157 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 ZNF521Q96K83 1311 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 BCAMP50895 628 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 FAM83AQ86UY5 434 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 ZNF333Q96JL9 665 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 BRCA2P51587 3418 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 KIF16BQ96L93 1317 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 FGFR2P21802 821 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 ARHGEF6Q15052 776 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 ERO1BQ86YB8 467 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 CETPP11597 493 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 WRNIP1Q96S55 665 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 USP44Q9H0E7 712 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 MAST3O60307 1309 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRN-209ENST00000451506 BTBD19C9JJ37 291 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 IRF6O14896 467 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 TLR2O60603 784 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 HOOK2Q96ED9 719 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 PTPRCP08575 1304 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 PPIL2Q13356 520 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 SNAPC2Q13487 334 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 NBPF11Q86T75 865 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRN-209ENST00000451506 DCAF15Q66K64 600 aa21.42■■□□□ 1.02
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