RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448393.6

IFI16-208, Transcript of interferon gamma inducible protein 16, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene IFI16, Length 2,245 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFI16-208	ENST00000448393	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	CDK15	Q96Q40	435 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	SH3GL3	Q99963	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	FAM107B	Q9H098	131 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	PDGFA	P04085	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	PAX7	P23759	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	USP5	P45974	858 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	VEGFB	P49765	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	ICA1	Q05084	483 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	EDEM1	Q92611	657 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	CSRNP1	Q96S65	589 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	PIF1	Q9H611	641 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	EML1	O00423	815 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	CDK2AP1	O14519	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	MBD3	O95983	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	FSHR	P23945	695 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	ORC1	Q13415	861 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFI16-208	ENST00000448393	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	PLIN1	O60240	522 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	IL2RA	P01589	272 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	ABCD1	P33897	745 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	GMPR	P36959	345 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	ZAP70	P43403	619 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	INHBE	P58166	350 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	ARID5A	Q03989	594 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	NLRP13	Q86W25	1043 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	XAGE2	Q96GT9	111 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	FRMD6	Q96NE9	622 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	TBX22	Q9Y458	520 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	MORC1	Q86VD1	984 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	EXOC4	Q96A65	974 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	ERO1A	Q96HE7	468 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	NGLY1	Q96IV0	654 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	TSPY26P	Q9H489	355 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	CORO7	P57737	925 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IFI16-208	ENST00000448393	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms