RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447419.6

PTX4-203, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,516 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-203ENST00000447419 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.22■■□□□ 1.63
PTX4-203ENST00000447419 ABCF2Q9UG63 623 aa25.22■■□□□ 1.63
PTX4-203ENST00000447419 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PTX4-203ENST00000447419 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.22■■□□□ 1.63
PTX4-203ENST00000447419 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.22■■□□□ 1.63
PTX4-203ENST00000447419 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PTX4-203ENST00000447419 MCAMP43121 646 aa25.21■■□□□ 1.63
PTX4-203ENST00000447419 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.21■■□□□ 1.63
PTX4-203ENST00000447419 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PTX4-203ENST00000447419 SEMA3EO15041 775 aa25.2■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.2■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 SPATA5Q8NB90 893 aa25.2■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 CDCA5Q96FF9 252 aa25.2■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.2■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.19■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.19■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.19■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.19■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.19■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 CACNB3P54284 484 aa25.18■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 TEKT1Q969V4 418 aa25.18■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 MYO1BO43795 1136 aa25.17■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 MMP14P50281 582 aa25.17■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 GRM1Q13255 1194 aa25.17■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.17■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 RAB11FIP3O75154 756 aa25.16■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.16■■□□□ 1.62
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PTX4-203ENST00000447419 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.15■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.15■■□□□ 1.62
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PTX4-203ENST00000447419 FZD1Q9UP38 647 aa25.15■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.15■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.15■■□□□ 1.62
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PTX4-203ENST00000447419 ZAP70P43403 619 aa25.14■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 PRKG1Q13976 671 aa25.14■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 MOB2Q70IA6 237 aa25.14■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 KLRG1Q96E93 195 aa25.14■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.14■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25.14■■□□□ 1.62
PTX4-203ENST00000447419 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 MAST3O60307 1309 aa25.13■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.13■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.13■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.12■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
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PTX4-203ENST00000447419 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.12■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 RASA3Q14644 834 aa25.11■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.11■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 ZNF384Q8TF68 577 aa25.11■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.11■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.1■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.1■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.1■■□□□ 1.61
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PTX4-203ENST00000447419 CNTNAP1P78357 1384 aa25.1■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 VEGFBP49765 207 aa25.09■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 HUNKP57058 714 aa25.09■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.09■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.09■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 PCNTO95613 3336 aa25.09■■□□□ 1.61
PTX4-203ENST00000447419 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.08■■□□□ 1.61
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PTX4-203ENST00000447419 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.07■■□□□ 1.6
PTX4-203ENST00000447419 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PTX4-203ENST00000447419 MRIQ9BWK5 157 aa25.07■■□□□ 1.6
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PTX4-203ENST00000447419 ZBTB22O15209 634 aa25.07■■□□□ 1.6
PTX4-203ENST00000447419 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.07■■□□□ 1.6
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PTX4-203ENST00000447419 USP40Q9NVE5 1235 aa25.07■■□□□ 1.6
PTX4-203ENST00000447419 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.06■■□□□ 1.6
PTX4-203ENST00000447419 TCP10Q12799 353 aa25.06■■□□□ 1.6
PTX4-203ENST00000447419 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PTX4-203ENST00000447419 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PTX4-203ENST00000447419 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.06■■□□□ 1.6
PTX4-203ENST00000447419 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PTX4-203ENST00000447419 BTDP43251 543 aa25.05■■□□□ 1.6
PTX4-203ENST00000447419 NFIAQ12857 509 aa25.05■■□□□ 1.6
PTX4-203ENST00000447419 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.05■■□□□ 1.6
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