RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 WNK4Q96J92 1243 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 CRKP46108 304 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 IREB2P48200 963 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 TNFAIP1Q13829 316 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 ALDH1L2Q3SY69 923 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 CAVIN4Q5BKX8 364 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 CDAN1Q8IWY9 1227 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 TCP10L2B9ZVM9 353 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM39BQ9GZU3 492 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 HPS5Q9UPZ3 1129 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 UNCXA6NJT0 531 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 EYA2O00167 538 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 FKTNO75072 461 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 FGFR2P21802 821 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 GJA5P36382 358 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 INHBEP58166 350 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 IFNL1Q8IU54 200 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 TEPSINQ96N21 525 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 CFHR5Q9BXR6 569 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 ELP3Q9H9T3 547 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-206ENST00000446904 ALDH1A1P00352 501 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 CACNB3P54284 484 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 TEKT1Q969V4 418 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC5A1P13866 664 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 TNNI2P48788 182 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 ATG9AQ7Z3C6 839 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 OPTNQ96CV9 577 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 SIL1Q9H173 461 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 ECM29Q5VYK3 1845 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 KIF16BQ96L93 1317 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 MAP3K9P80192 1104 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 LPIN2Q92539 896 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 ZDHHC15Q96MV8 337 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 CRHR2Q13324 411 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 VGLL4Q14135 290 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 PTPN18Q99952 460 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 MRIQ9BWK5 157 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 TMOD2Q9NZR1 351 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 CCER2I3L3R5 266 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 CIAO1O76071 339 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP2B3Q16720 1220 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 HHIPL2Q6UWX4 724 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR66Q8TBY9 1149 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 CEP126Q9P2H0 1117 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIM17Q9Y577 477 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 CSADQ9Y600 493 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 MAST3O60307 1309 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 ARAP2Q8WZ64 1704 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 RARSP54136 660 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 DIXDC1Q155Q3 683 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 CCL15Q16663 113 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 FKBP1CQ5VVH2 108 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 OTOP1Q7RTM1 612 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 BRI3BPQ8WY22 251 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 OTUD5Q96G74 571 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 MS4A4AQ96JQ5 239 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 MEIS3Q99687 375 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 FBXO3Q9UK99 471 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-206ENST00000446904 HTTP42858 3142 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP4-206ENST00000446904 ADORA1P30542 326 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP4-206ENST00000446904 IL15P40933 162 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP4-206ENST00000446904 PHKA1P46020 1223 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM83AQ86UY5 434 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP4-206ENST00000446904 CD99L2Q8TCZ2 262 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP4-206ENST00000446904 WRNIP1Q96S55 665 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP4-206ENST00000446904 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP4-206ENST00000446904 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP4-206ENST00000446904 PRDX5P30044 214 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP4-206ENST00000446904 GTF2A2P52657 109 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP4-206ENST00000446904 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP4-206ENST00000446904 MIGA2Q7L4E1 593 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP4-206ENST00000446904 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms