RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.69■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.69■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.69■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 SPATA5Q8NB90 893 aa20.69■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 TEKT1Q969V4 418 aa20.69■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 ADM5C9JUS6 153 aa20.68■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.68■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 AACSQ86V21 672 aa20.68■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.68■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.68■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 MCAMP43121 646 aa20.67■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 HTRA3P83110 453 aa20.67■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.67■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 IGSF3O75054 1194 aa20.66■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 PRDX5P30044 214 aa20.66■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 APBB1O00213 710 aa20.65■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.65■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 CDCA5Q96FF9 252 aa20.65■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.65■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 ABCF2Q9UG63 623 aa20.65■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
RABGEF1-204ENST00000442563 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 DLK2Q6UY11 383 aa20.64■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.64■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 SLF2Q8IX21 1173 aa20.64■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.64■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 CLRN2A0PK11 232 aa20.63■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 RASSF10A6NK89 507 aa20.63■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 PI16Q6UXB8 463 aa20.63■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 KLRG1Q96E93 195 aa20.63■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.63■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.63■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 AOX1Q06278 1338 aa20.62■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFAIP1Q13829 316 aa20.62■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.62■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.62■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.62■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.62■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.62■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.62■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.61■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 FKBP1BP68106 108 aa20.61■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.61■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.61■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.61■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.61■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 VEZTQ9HBM0 779 aa20.61■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 SNRKQ9NRH2 765 aa20.61■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 GAKO14976 1311 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 ZAP70P43403 619 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 CNTNAP1P78357 1384 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 LDHCP07864 332 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 NF2P35240 595 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 TNNI2P48788 182 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 GSTO1P78417 241 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 MECOMQ03112 1051 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 RASA3Q14644 834 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 GCC1Q96CN9 775 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 RAI14Q9P0K7 980 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP5JP18859 108 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGEF1-204ENST00000442563 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGEF1-204ENST00000442563 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM83AQ86UY5 434 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGEF1-204ENST00000442563 JMYQ8N9B5 988 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF384Q8TF68 577 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
RABGEF1-204ENST00000442563 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
RABGEF1-204ENST00000442563 USP40Q9NVE5 1235 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGEF1-204ENST00000442563 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGEF1-204ENST00000442563 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGEF1-204ENST00000442563 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGEF1-204ENST00000442563 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGEF1-204ENST00000442563 ECE1P42892 770 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGEF1-204ENST00000442563 HUNKP57058 714 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms