RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 OPTNQ96CV9 577 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-210ENST00000442481 PTPN18Q99952 460 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-210ENST00000442481 CSADQ9Y600 493 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAME-210ENST00000442481 UBE4AQ14139 1066 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-210ENST00000442481 KIF22Q14807 665 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-210ENST00000442481 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAME-210ENST00000442481 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GUL6 1792 aa14.67□□□□□ -0.06
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PRAME-210ENST00000442481 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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PRAME-210ENST00000442481 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAME-210ENST00000442481 ELP3Q9H9T3 547 aa14.66□□□□□ -0.06
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PRAME-210ENST00000442481 SMC4Q9NTJ3 1288 aa14.66□□□□□ -0.06
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PRAME-210ENST00000442481 CCL15Q16663 113 aa14.65□□□□□ -0.06
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PRAME-210ENST00000442481 JAG2Q9Y219 1238 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAME-210ENST00000442481 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.65□□□□□ -0.06
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PRAME-210ENST00000442481 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 BEND3Q5T5X7 828 aa14.64□□□□□ -0.07
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PRAME-210ENST00000442481 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.64□□□□□ -0.07
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PRAME-210ENST00000442481 ALDH1L1O75891 902 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 CETPP11597 493 aa14.63□□□□□ -0.07
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF333Q96JL9 665 aa14.63□□□□□ -0.07
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PRAME-210ENST00000442481 DCAF15Q66K64 600 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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PRAME-210ENST00000442481 OTUD5Q96G74 571 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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PRAME-210ENST00000442481 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 TLR2O60603 784 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 GYG1P46976 350 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 FAM83AQ86UY5 434 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 TEPSINQ96N21 525 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 PTPRCP08575 1304 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 HOXD10P28358 340 aa14.59□□□□□ -0.07
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PRAME-210ENST00000442481 CEP290O15078 2479 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-210ENST00000442481 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.59□□□□□ -0.07
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PRAME-210ENST00000442481 PPIL2Q13356 520 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-210ENST00000442481 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-210ENST00000442481 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-210ENST00000442481 WRNIP1Q96S55 665 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-210ENST00000442481 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PRAME-210ENST00000442481 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRAME-210ENST00000442481 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRAME-210ENST00000442481 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRAME-210ENST00000442481 METTL24Q5JXM2 366 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-210ENST00000442481 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-210ENST00000442481 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-210ENST00000442481 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-210ENST00000442481 KIF16BQ96L93 1317 aa14.57□□□□□ -0.08
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