RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438219.1

HCFC1-AS1-201, HCFC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HCFC1-AS1, Length 350 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RASA3Q14644 834 aa17.68■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 C1orf115Q9H7X2 142 aa17.68■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SERPINA10Q9UK55 444 aa17.68■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HDAC5Q9UQL6 1122 aa17.68■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 A0A1B0GUL6 1792 aa17.68■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa17.67■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TRPA1O75762 1119 aa17.67■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GNAI2P04899 355 aa17.67■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RLBP1P12271 317 aa17.67■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PHKA1P46020 1223 aa17.67■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SPDYE2Q495Y8 402 aa17.67■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ARMC9Q7Z3E5 817 aa17.67■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RNF186Q9NXI6 227 aa17.67■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZBED9Q6R2W3 1325 aa17.67■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa17.66■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CLMNQ96JQ2 1002 aa17.66■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 THSD7BQ9C0I4 1608 aa17.65■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TMEM39BQ9GZU3 492 aa17.65■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FBXO3Q9UK99 471 aa17.65■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SSC5DA1L4H1 1573 aa17.65■□□□□ 0.42
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MTX1Q13505 466 aa17.64■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DIXDC1Q155Q3 683 aa17.64■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 LDLRAD1Q5T700 205 aa17.64■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ITPRIPQ8IWB1 547 aa17.64■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TEKT1Q969V4 418 aa17.64■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CA12O43570 354 aa17.63■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 USP2O75604 605 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PRDX5P30044 214 aa17.63■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa17.63■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CCDC102BQ68D86 513 aa17.63■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PANK1Q8TE04 598 aa17.63■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NEUROD6Q96NK8 337 aa17.63■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa17.63■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 A0A1B0GUL7 405 aa17.62■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 WDR66Q8TBY9 1149 aa17.62■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SLC10A4Q96EP9 437 aa17.62■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 XAGE2Q96GT9 111 aa17.62■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa17.61■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZDHHC15Q96MV8 337 aa17.61■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TEPSINQ96N21 525 aa17.61■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TBC1D8O95759 1140 aa17.6■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP17.6■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RASGRF1Q13972 1273 aa17.6■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SPRYD7Q5W111 196 aa17.6■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ATP8B2P98198 1209 aa17.59■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TNFAIP1Q13829 316 aa17.59■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MAP3K11Q16584 847 aa17.59■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ABHD8Q96I13 439 aa17.59■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DENND2AQ9ULE3 1009 aa17.59■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa17.59■□□□□ 0.41
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 LDHBP07195 334 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 IREB2P48200 963 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TNNI2P48788 182 aa17.58■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HHIPL2Q6UWX4 724 aa17.58■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PI16Q6UXB8 463 aa17.58■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MRIQ9BWK5 157 aa17.58■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ELP3Q9H9T3 547 aa17.58■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SAGE1Q9NXZ1 904 aa17.58■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ABCF2Q9UG63 623 aa17.58■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 AKAP2Q9Y2D5 859 aa17.58■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa17.58■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MAST3O60307 1309 aa17.57■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GJA5P36382 358 aa17.57■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TCP10Q12799 353 aa17.57■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 POLA2Q14181 598 aa17.57■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GORABQ5T7V8 394 aa17.57■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa17.57■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.57■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 WNK4Q96J92 1243 aa17.57■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MCOLN1Q9GZU1 580 aa17.57■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa17.57■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SURF6O75683 361 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TM4SF4P48230 202 aa17.56■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NFIAQ12857 509 aa17.56■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DGKZQ13574 1117 aa17.56■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa17.56■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 USP40Q9NVE5 1235 aa17.56■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TMOD2Q9NZR1 351 aa17.56■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SEMA3EO15041 775 aa17.55■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MVPQ14764 893 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MIGA2Q7L4E1 593 aa17.55■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZFPM1Q8IX07 1006 aa17.55■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa17.55■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SSH3Q8TE77 659 aa17.55■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HMG20BQ9P0W2 317 aa17.55■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SALL1Q9NSC2 1324 aa17.54■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MAP3K9P80192 1104 aa17.54■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SNRKQ9NRH2 765 aa17.54■□□□□ 0.4
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CCDC85CA6NKD9 419 aa17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms