RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436673.5

UPP1-208, Transcript of uridine phosphorylase 1, human

TSL 5

Gene UPP1, Length 918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UPP1-208	ENST00000436673	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		33.18	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	IFNL1	Q8IU54	200 aa		33.17	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		33.17	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	SOX10	P56693	466 aa		33.16	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	FKTN	O75072	461 aa		33.15	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		33.15	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	TEPSIN	Q96N21	525 aa		33.15	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		33.15	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	KIF16B	Q96L93	1317 aa		33.14	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	BCAM	P50895	628 aa		33.14	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
UPP1-208	ENST00000436673	FGFR2	P21802	821 aa		33.13	■■■□□ 2.89
UPP1-208	ENST00000436673	GJA5	P36382	358 aa		33.13	■■■□□ 2.89
UPP1-208	ENST00000436673	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
UPP1-208	ENST00000436673	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
UPP1-208	ENST00000436673	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		33.13	■■■□□ 2.89
UPP1-208	ENST00000436673	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		33.12	■■■□□ 2.89
UPP1-208	ENST00000436673	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	33.12	■■■□□ 2.89
UPP1-208	ENST00000436673	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
UPP1-208	ENST00000436673	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		33.11	■■■□□ 2.89
UPP1-208	ENST00000436673	EYA2	O00167	538 aa		33.1	■■■□□ 2.89
UPP1-208	ENST00000436673	TNNI2	P48788	182 aa		33.1	■■■□□ 2.89
UPP1-208	ENST00000436673	TEKT1	Q969V4	418 aa		33.1	■■■□□ 2.89
UPP1-208	ENST00000436673	LAMB1	P07942	1786 aa		33.1	■■■□□ 2.89
UPP1-208	ENST00000436673	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
UPP1-208	ENST00000436673	MRI	Q9BWK5	157 aa		33.09	■■■□□ 2.89
UPP1-208	ENST00000436673	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		33.08	■■■□□ 2.89
UPP1-208	ENST00000436673	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		33.08	■■■□□ 2.89
UPP1-208	ENST00000436673	ELP3	Q9H9T3	547 aa		33.07	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		33.06	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	LPIN2	Q92539	896 aa		33.06	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	OPTN	Q96CV9	577 aa		33.06	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	SLC5A1	P13866	664 aa		33.05	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	CACNB3	P54284	484 aa		33.05	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	PTPN18	Q99952	460 aa		33.05	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	OTOF	Q9HC10	1997 aa		33.05	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	MAST3	O60307	1309 aa		33.04	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		33.04	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	33.04	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	MAP3K9	P80192	1104 aa		33.03	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	VGLL4	Q14135	290 aa		33.03	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	CRHR2	Q13324	411 aa		33.02	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		33.02	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	FBXO3	Q9UK99	471 aa		33.02	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	HTT	P42858	3142 aa		33.02	■■■□□ 2.88
UPP1-208	ENST00000436673	CIAO1	O76071	339 aa		33.01	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		33.01	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		33.01	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	FAM83A	Q86UY5	434 aa		33.01	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		33.01	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		33.01	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		33.01	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	SIL1	Q9H173	461 aa		33	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	TRIM17	Q9Y577	477 aa		32.99	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	CSAD	Q9Y600	493 aa		32.99	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		32.98	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	ATP2B3	Q16720	1220 aa		32.97	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		32.97	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		32.97	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	ERO1A	Q96HE7	468 aa		32.96	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		32.96	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	CCER2	I3L3R5	266 aa		32.95	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	GTF2A2	P52657	109 aa		32.95	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	OTUD5	Q96G74	571 aa		32.95	■■■□□ 2.87
UPP1-208	ENST00000436673	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		32.94	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	HOOK2	Q96ED9	719 aa		32.94	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		32.94	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		32.93	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		32.93	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	CCL15	Q16663	113 aa		32.93	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	WRNIP1	Q96S55	665 aa		32.93	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	MEIS3	Q99687	375 aa		32.93	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		32.93	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	SP3	Q02447	781 aa		32.92	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		32.92	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	PRDX5	P30044	214 aa		32.91	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	COPRS	Q9NQ92	184 aa		32.91	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		32.9	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	ERO1B	Q86YB8	467 aa		32.9	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		32.9	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		32.89	■■■□□ 2.86
UPP1-208	ENST00000436673	SEMA3E	O15041	775 aa		32.89	■■■□□ 2.86

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms