RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa11.68□□□□□ -0.54
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNAPC2Q13487 334 aa11.64□□□□□ -0.55
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RIC3Q7Z5B4 369 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CD320Q9NPF0 282 aa11.64□□□□□ -0.55
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPN5P54829 565 aa11.63□□□□□ -0.55
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKS1AQ92625 1134 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHD7Q9P2D1 2997 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM32Q13049 653 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MFSD14AQ96MC6 490 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RTP1P59025 263 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RASA3Q14644 834 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DLGAP5Q15398 846 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FRMPD3Q5JV73 1810 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
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