RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428818.5

TTC28-AS1-208, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene TTC28-AS1, Length 706 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PHKA1P46020 1223 aa11.69□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 BCAMP50895 628 aa11.69□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 GTF2IP78347 998 aa11.69□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CDAN1Q8IWY9 1227 aa11.69□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.69□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 FOCADQ5VW36 1801 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 USP17L3A6NCW0 530 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 USP17L4A6NCW7 530 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SNPHO15079 494 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SURF6O75683 361 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 VIL1P09327 827 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SLC5A1P13866 664 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 IL1R1P14778 569 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 USP17L1Q7RTZ2 530 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ZNF804AQ7Z570 1209 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 FBXO33Q7Z6M2 555 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 GMLQ99445 158 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa11.68□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 AK9Q5TCS8 1911 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 A0A1B0GUL7 405 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TIMM10P62072 90 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TNIP1Q15025 636 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PI16Q6UXB8 463 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DLK2Q6UY11 383 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 EXOC6Q8TAG9 804 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CEP126Q9P2H0 1117 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 HDAC5Q9UQL6 1122 aa11.67□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 IQCA1LA6NCM1 817 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 F8W031 263 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 C1QTNF8P60827 252 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 HTRA3P83110 453 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SCARF1Q14162 830 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PODNQ7Z5L7 613 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LPIN2Q92539 896 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 XAGE2Q96GT9 111 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DBNDD2Q9BQY9 259 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 BCL11AQ9H165 835 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 FAM205AQ6ZU69 1335 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TNNI3KQ59H18 835 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 STRIP1Q5VSL9 837 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TTLL5Q6EMB2 1281 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa11.65□□□□□ -0.54
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TRAF5O00463 557 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 TOMM70O94826 608 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RASGRF1Q13972 1273 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CCDC102BQ68D86 513 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 LDHDQ86WU2 507 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SIPA1L1O43166 1804 aa11.64□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NAV1Q8NEY1 1877 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 PCNTO95613 3336 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ADM5C9JUS6 153 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RPS12P25398 132 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 VPS37DQ86XT2 251 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 AGBL3Q8NEM8 1001 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MARVELD3Q96A59 401 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NEUROD6Q96NK8 337 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 GGA3Q9NZ52 723 aa11.63□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SSC5DA1L4H1 1573 aa11.62□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 USP17L8P0C7I0 530 aa11.62□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 MCAMP43121 646 aa11.62□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 NBPF9Q3BBW0 867 aa11.62□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 CAVIN4Q5BKX8 364 aa11.62□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TTC28-AS1-208ENST00000428818 SMC1BQ8NDV3 1235 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms