RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANP32CO43423 234 aa16.63■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD99L2Q8TCZ2 262 aa16.63■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OPTNQ96CV9 577 aa16.63■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KAZALD1Q96I82 304 aa16.63■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEPSINQ96N21 525 aa16.63■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELP3Q9H9T3 547 aa16.63■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MROH5Q6ZUA9 1318 aa16.63■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRCA2P51587 3418 aa16.63■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDAN1Q8IWY9 1227 aa16.62■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPN18Q99952 460 aa16.62■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRKP46108 304 aa16.61■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNNI2P48788 182 aa16.61■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPN22Q9Y2R2 807 aa16.61■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa16.61■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UTYO14607 1347 aa16.61■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCP10L2B9ZVM9 353 aa16.61■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM39BQ9GZU3 492 aa16.61■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFCC1Q9HA90 598 aa16.61■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POTEFA5A3E0 1075 aa16.6■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SP3Q02447 781 aa16.6■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VGLL4Q14135 290 aa16.6■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRIK5Q16478 980 aa16.6■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO33Q7Z6M2 555 aa16.6■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS37DQ86XT2 251 aa16.6■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MS4A4AQ96JQ5 239 aa16.6■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa16.59■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRI3BPQ8WY22 251 aa16.59■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARMC5Q96C12 935 aa16.59■□□□□ 0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa16.58■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP3K9P80192 1104 aa16.58■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAP1Q01518 475 aa16.58■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCL15Q16663 113 aa16.58■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC24Q50LG9 513 aa16.58■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METTL24Q5JXM2 366 aa16.58■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD44Q8N8A2 993 aa16.58■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VGLL2Q8N8G2 317 aa16.58■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSADQ9Y600 493 aa16.58■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTF2A2P52657 109 aa16.57■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.57■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM9BQ8IZU0 186 aa16.57■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEKT1Q969V4 418 aa16.57■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OTUD5Q96G74 571 aa16.57■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYH13Q9UKX3 1938 aa16.57■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDE8BO95263 885 aa16.56■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNB3P54284 484 aa16.56■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa16.56■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPDYE5A6NIY4 337 aa16.55■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCC1Q96CN9 775 aa16.55■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMOD2Q9NZR1 351 aa16.55■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF521Q96K83 1311 aa16.55■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM43AQ8N2R8 423 aa16.54■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHDC4Q8TBB5 520 aa16.54■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDHHC15Q96MV8 337 aa16.54■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa16.54■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAST3O60307 1309 aa16.54■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPRCP08575 1304 aa16.54■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIF16BQ96L93 1317 aa16.54■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCAMP50895 628 aa16.54■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGEF6Q15052 776 aa16.54■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM83AQ86UY5 434 aa16.54■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WRNIP1Q96S55 665 aa16.54■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRIQ9BWK5 157 aa16.54■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa16.54■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa16.53■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FKBP1CQ5VVH2 108 aa16.53■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERO1BQ86YB8 467 aa16.53■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF333Q96JL9 665 aa16.53■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa16.53■□□□□ 0.24
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CETPP11597 493 aa16.52■□□□□ 0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EN2P19622 333 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGFR2P21802 821 aa16.52■□□□□ 0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOOK2Q96ED9 719 aa16.52■□□□□ 0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa16.51■□□□□ 0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HHIPL2Q6UWX4 724 aa16.51■□□□□ 0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM106CQ9BVX2 250 aa16.51■□□□□ 0.23
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