RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.37■□□□□ 0.85
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SEC24BO95487 1268 aa20.37■□□□□ 0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHGBP05060 677 aa20.37■□□□□ 0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 LDHCP07864 332 aa20.37■□□□□ 0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYP7A1P22680 504 aa20.37■□□□□ 0.85
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 CERS3Q8IU89 383 aa20.34■□□□□ 0.85
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.31■□□□□ 0.84
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP4K1Q92918 833 aa20.3■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.3■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.3■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.29■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 OGFOD1Q8N543 542 aa20.29■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARMT1Q9H993 441 aa20.29■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF181Q9P0P0 153 aa20.29■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.28■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 AK9Q5TCS8 1911 aa20.28■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLCG2P16885 1265 aa20.28■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 MCCP23508 829 aa20.28■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTH1RQ03431 593 aa20.28■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCORLQ8N3X6 602 aa20.28■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.28■□□□□ 0.84
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.27■□□□□ 0.84
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CRKP46108 304 aa20.27■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCNN1DP51172 638 aa20.27■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.27■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 DPF2Q92785 391 aa20.27■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.27■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 VPS53Q5VIR6 699 aa20.26■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPC2Q8N158 579 aa20.26■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.26■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.26■□□□□ 0.83
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