RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 HMMRO75330 724 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 RASGRF1Q13972 1273 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 VEZTQ9HBM0 779 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 MAST3O60307 1309 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 HUNKP57058 714 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 ECE1P42892 770 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 CAPNS2Q96L46 248 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 PRDX5P30044 214 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 GRM1Q13255 1194 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 NF2P35240 595 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 FKBP1BP68106 108 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCF2Q9UG63 623 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA5Q8NB90 893 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 RASA3Q14644 834 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 TNFAIP1Q13829 316 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 DIXDC1Q155Q3 683 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 RGMBQ6NW40 437 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 MOB2Q70IA6 237 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 APBB1O00213 710 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB11FIP3O75154 756 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 MCAMP43121 646 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 PI16Q6UXB8 463 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 AOC2O75106 756 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 PRKG1Q13976 671 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP2K2P36507 400 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 TNNI2P48788 182 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 AACSQ86V21 672 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC102AQ96A19 550 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 SNRKQ9NRH2 765 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP4-204ENST00000416021 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 CACNB3P54284 484 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 SLF2Q8IX21 1173 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 PCNTO95613 3336 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 MECOMQ03112 1051 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 USP40Q9NVE5 1235 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 WBP1LQ9NX94 342 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 TEPSINQ96N21 525 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 CRBNQ96SW2 442 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 BCL11AQ9H165 835 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 RAI14Q9P0K7 980 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP4-204ENST00000416021 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
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