RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.34■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 UNCXA6NJT0 531 aa24.33■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 KAZALD1Q96I82 304 aa24.33■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 GRIK5Q16478 980 aa24.32■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 LRRC24Q50LG9 513 aa24.32■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.32■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.32■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 CACNB3P54284 484 aa24.31■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.31■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 PTPN18Q99952 460 aa24.3■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 EFCC1Q9HA90 598 aa24.3■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 CSADQ9Y600 493 aa24.3■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 SP3Q02447 781 aa24.29■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.29■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.28■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 MAP3K9P80192 1104 aa24.28■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 VGLL4Q14135 290 aa24.28■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 CCL15Q16663 113 aa24.28■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.28■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 TEKT1Q969V4 418 aa24.28■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 OTUD5Q96G74 571 aa24.28■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 TEPSINQ96N21 525 aa24.28■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.28■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.28■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 POTEFA5A3E0 1075 aa24.27■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 BCAMP50895 628 aa24.27■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.27■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.27■■□□□ 1.48
UBXN4-202ENST00000415164 UTYO14607 1347 aa24.26■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 PDE8BO95263 885 aa24.25■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 GTF2A2P52657 109 aa24.25■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.25■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 OTOFQ9HC10 1997 aa24.24■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.24■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.24■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.24■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 WRNIP1Q96S55 665 aa24.23■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 PTPRCP08575 1304 aa24.22■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 HTTP42858 3142 aa24.21■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
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UBXN4-202ENST00000415164 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.21■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.21■■□□□ 1.47
UBXN4-202ENST00000415164 MAST3O60307 1309 aa24.2■■□□□ 1.46
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UBXN4-202ENST00000415164 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
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UBXN4-202ENST00000415164 ZDHHC15Q96MV8 337 aa24.19■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.19■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.19■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF521Q96K83 1311 aa24.18■■□□□ 1.46
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UBXN4-202ENST00000415164 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.18■■□□□ 1.46
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UBXN4-202ENST00000415164 USP44Q9H0E7 712 aa24.18■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.18■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.18■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 CETPP11597 493 aa24.17■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 DCAF15Q66K64 600 aa24.17■■□□□ 1.46
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UBXN4-202ENST00000415164 SIL1Q9H173 461 aa24.17■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 LAMB1P07942 1786 aa24.16■■□□□ 1.46
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UBXN4-202ENST00000415164 SNAPC2Q13487 334 aa24.16■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 KIF22Q14807 665 aa24.16■■□□□ 1.46
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UBXN4-202ENST00000415164 CENPFP49454 3210 aa24.16■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 IRF6O14896 467 aa24.15■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 FGFR2P21802 821 aa24.15■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 TCP10Q12799 353 aa24.15■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.15■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 NBPF11Q86T75 865 aa24.15■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.15■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.15■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.15■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa24.15■■□□□ 1.46
UBXN4-202ENST00000415164 BTBD19C9JJ37 291 aa24.14■■□□□ 1.45
UBXN4-202ENST00000415164 HHIPL2Q6UWX4 724 aa24.14■■□□□ 1.45
UBXN4-202ENST00000415164 LPIN2Q92539 896 aa24.14■■□□□ 1.45
UBXN4-202ENST00000415164 GCC1Q96CN9 775 aa24.14■■□□□ 1.45
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