RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400824.8

AFDN-208, Transcript of afadin, adherens junction formation factor, human

TSL 5

Gene AFDN, Length 875 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFDN-208	ENST00000400824	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
AFDN-208	ENST00000400824	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
AFDN-208	ENST00000400824	EFCC1	Q9HA90	598 aa		33.25	■■■□□ 2.91
AFDN-208	ENST00000400824	CAP1	Q01518	475 aa		33.24	■■■□□ 2.91
AFDN-208	ENST00000400824	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
AFDN-208	ENST00000400824	ARMC5	Q96C12	935 aa		33.23	■■■□□ 2.91
AFDN-208	ENST00000400824	KAZALD1	Q96I82	304 aa		33.23	■■■□□ 2.91
AFDN-208	ENST00000400824	CRK	P46108	304 aa		33.22	■■■□□ 2.91
AFDN-208	ENST00000400824	GCC1	Q96CN9	775 aa		33.22	■■■□□ 2.91
AFDN-208	ENST00000400824	SUCLG2	Q96I99	432 aa		33.22	■■■□□ 2.91
AFDN-208	ENST00000400824	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		33.22	■■■□□ 2.91
AFDN-208	ENST00000400824	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		33.22	■■■□□ 2.91
AFDN-208	ENST00000400824	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		33.21	■■■□□ 2.91
AFDN-208	ENST00000400824	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		33.2	■■■□□ 2.91
AFDN-208	ENST00000400824	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		33.2	■■■□□ 2.91
AFDN-208	ENST00000400824	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		33.2	■■■□□ 2.91
AFDN-208	ENST00000400824	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		33.2	■■■□□ 2.91
AFDN-208	ENST00000400824	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	33.19	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	TNNI2	P48788	182 aa		33.18	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	MAP3K9	P80192	1104 aa		33.18	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	VGLL4	Q14135	290 aa		33.18	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	GRIK5	Q16478	980 aa		33.18	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		33.18	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		33.18	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	GTF2A2	P52657	109 aa		33.17	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		33.16	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	CCL15	Q16663	113 aa		33.16	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	UTY	O14607	1347 aa		33.16	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	BRCA2	P51587	3418 aa		33.15	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		33.15	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	CSAD	Q9Y600	493 aa		33.14	■■■□□ 2.9
AFDN-208	ENST00000400824	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	VPS37D	Q86XT2	251 aa		33.13	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		33.13	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		33.13	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	OTUD5	Q96G74	571 aa		33.12	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	ZNF333	Q96JL9	665 aa		33.12	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	ARHGEF6	Q15052	776 aa		33.11	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	LRRC24	Q50LG9	513 aa		33.11	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		33.1	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	CACNB3	P54284	484 aa		33.1	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		33.1	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		33.1	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	TEKT1	Q969V4	418 aa		33.1	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	METTL24	Q5JXM2	366 aa		33.09	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		33.09	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		33.09	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	MRI	Q9BWK5	157 aa		33.09	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		33.09	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		33.09	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
AFDN-208	ENST00000400824	PDE8B	O95263	885 aa		33.07	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		33.07	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		33.06	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	NBPF11	Q86T75	865 aa		33.06	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	FAM83A	Q86UY5	434 aa		33.06	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	ERO1B	Q86YB8	467 aa		33.06	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	ANP32C	O43423	234 aa		33.05	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	CETP	P11597	493 aa		33.05	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	BCAM	P50895	628 aa		33.05	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		33.05	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	CEP290	O15078	2479 aa		33.05	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		33.05	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	TLR2	O60603	784 aa		33.04	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	WRNIP1	Q96S55	665 aa		33.04	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		33.04	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		33.03	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	BTBD19	C9JJ37	291 aa		33.02	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	IRF6	O14896	467 aa		33.02	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		33.02	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	HOOK2	Q96ED9	719 aa		33.02	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	MAST3	O60307	1309 aa		33.02	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	KIF16B	Q96L93	1317 aa		33.02	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.88
AFDN-208	ENST00000400824	SNAPC2	Q13487	334 aa		33.01	■■■□□ 2.87
AFDN-208	ENST00000400824	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		33.01	■■■□□ 2.87
AFDN-208	ENST00000400824	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
AFDN-208	ENST00000400824	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		33.01	■■■□□ 2.87
AFDN-208	ENST00000400824	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		33	■■■□□ 2.87
AFDN-208	ENST00000400824	FGFR2	P21802	821 aa		33	■■■□□ 2.87
AFDN-208	ENST00000400824	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
AFDN-208	ENST00000400824	PPIL2	Q13356	520 aa		33	■■■□□ 2.87
AFDN-208	ENST00000400824	KIF22	Q14807	665 aa		32.98	■■■□□ 2.87
AFDN-208	ENST00000400824	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		32.98	■■■□□ 2.87
AFDN-208	ENST00000400824	DCAF15	Q66K64	600 aa		32.98	■■■□□ 2.87
AFDN-208	ENST00000400824	ZNF521	Q96K83	1311 aa		32.98	■■■□□ 2.87
AFDN-208	ENST00000400824	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
AFDN-208	ENST00000400824	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		32.97	■■■□□ 2.87

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