RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYO1BO43795 1136 aa18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LDHBP07195 334 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MCAMP43121 646 aa18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP18.71■□□□□ 0.59
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TEKT1Q969V4 418 aa18.71■□□□□ 0.59
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPDYE6P0CI01 402 aa18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRKP46108 304 aa18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CFAP100Q494V2 611 aa18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HHIPL2Q6UWX4 724 aa18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLF2Q8IX21 1173 aa18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GGA3Q9NZ52 723 aa18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCN9AQ15858 1988 aa18.7■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRDX5P30044 214 aa18.69■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP18.69■□□□□ 0.58
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SULF1Q8IWU6 871 aa18.69■□□□□ 0.58
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PASKQ96RG2 1323 aa18.69■□□□□ 0.58
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRT26Q7Z3Y9 468 aa18.68■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZDHHC15Q96MV8 337 aa18.68■□□□□ 0.58
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa18.68■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 APLP1P51693 650 aa18.67■□□□□ 0.58
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMC5Q8IY18 1101 aa18.67■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPATCH3Q96I76 525 aa18.67■□□□□ 0.58
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GSTO1P78417 241 aa18.66■□□□□ 0.58
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZAP70P43403 619 aa18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNFAIP1Q13829 316 aa18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ECHDC1Q9NTX5 307 aa18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRP2BPQ9P2M1 347 aa18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LDHCP07864 332 aa18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPDYE2Q495Y8 402 aa18.64■□□□□ 0.57
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNRKQ9NRH2 765 aa18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSME4Q14997 1843 aa18.64■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAKO14976 1311 aa18.64■□□□□ 0.57
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CREBZFQ9NS37 354 aa18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMOD2Q9NZR1 351 aa18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAI14Q9P0K7 980 aa18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa18.63■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM88BA6NKF7 163 aa18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHDP01880 384 aa18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DIXDC1Q155Q3 683 aa18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FKBP1CQ5VVH2 108 aa18.62■□□□□ 0.57
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTC41PQ6P2S7 1318 aa18.62■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa18.61■□□□□ 0.57
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAF5O00463 557 aa18.61■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HAUS7Q99871 368 aa18.61■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCL11AQ9H165 835 aa18.61■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERC2O15083 957 aa18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNNI2P48788 182 aa18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUCB1Q02818 461 aa18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAP3K12Q12852 859 aa18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEFB129Q9H1M3 183 aa18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VEZTQ9HBM0 779 aa18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CELF2O95319 508 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEFLP07196 543 aa18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM83AQ86UY5 434 aa18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CERS3Q8IU89 383 aa18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDCA5Q96FF9 252 aa18.59■□□□□ 0.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
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