RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397070.6

TM2D2-201, Transcript of TM2 domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TM2D2, Length 1,631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D2-201ENST00000397070 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.58■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.58■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.57■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.57■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 RXRBP28702 533 aa21.57■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 MCM5P33992 734 aa21.57■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 F13A1P00488 732 aa21.56■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 APPP05067 770 aa21.56■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.56■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 MYH6P13533 1939 aa21.56■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 XDHP47989 1333 aa21.56■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 IGSF3O75054 1194 aa21.55■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 EVCP57679 992 aa21.55■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 AKT1S1Q96B36 256 aa21.55■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 DDR1Q08345 913 aa21.55■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 TRDNQ13061 729 aa21.55■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 STK3Q13188 491 aa21.55■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.55■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.55■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.55■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 NBPF3Q9H094 633 aa21.55■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 ARMT1Q9H993 441 aa21.55■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 MTMR6Q9Y217 621 aa21.55■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.54■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 APBA3O96018 575 aa21.54■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 CYP7A1P22680 504 aa21.54■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 APOBRQ0VD83 1088 aa21.54■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 NAPBQ9H115 298 aa21.54■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 RAI14Q9P0K7 980 aa21.54■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 ABCF2Q9UG63 623 aa21.54■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 EP400Q96L91 3159 aa21.54■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.53■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 PRC1O43663 620 aa21.53■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 KLRK1P26718 216 aa21.53■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 LCORLQ8N3X6 602 aa21.53■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.53■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 SCRN1Q12765 414 aa21.52■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 ZNF827Q17R98 1081 aa21.52■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.52■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.52■■□□□ 1.04
TM2D2-201ENST00000397070 FOCADQ5VW36 1801 aa21.52■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.51■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 TMEM87AQ8NBN3 555 aa21.51■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.51■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.51■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.51■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 MBD3O95983 291 aa21.51■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 ANTXR2P58335 489 aa21.51■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 TMC4Q7Z404 712 aa21.51■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.51■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 KIF3AQ9Y496 699 aa21.51■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.5■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.5■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 BBOX1O75936 387 aa21.49■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 TDO2P48775 406 aa21.49■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 CHST3Q7LGC8 479 aa21.49■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 ATP2B4P23634 1241 aa21.48■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.48■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.48■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 TMEM87BQ96K49 555 aa21.48■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.47■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.47■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.47■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.47■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 FSD2A1L4K1 749 aa21.47■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 JAK2O60674 1132 aa21.47■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.47■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.47■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 KRT23Q9C075 422 aa21.47■■□□□ 1.03
TM2D2-201ENST00000397070 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.8 ms