RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395549.3

ATG13-202, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 5

Gene ATG13, Length 937 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-202ENST00000395549 PRKG1Q13976 671 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 ADORA1P30542 326 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 TSKSQ9UJT2 592 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 MAST3O60307 1309 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 PHKA1P46020 1223 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 TFCP2Q12800 502 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 TEKT1Q969V4 418 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 OTOFQ9HC10 1997 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 CA12O43570 354 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 RASA3Q14644 834 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 FZD1Q9UP38 647 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 A0A1B0GUL7 405 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 TIMM10P62072 90 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 TNFAIP1Q13829 316 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 CCDC102BQ68D86 513 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 SEMA3EO15041 775 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 PANK1Q8TE04 598 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 XAGE2Q96GT9 111 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG13-202ENST00000395549 AK9Q5TCS8 1911 aa20.33■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 PRDX5P30044 214 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 ATP8B2P98198 1209 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 POLA2Q14181 598 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 CSRNP1Q96S65 589 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 MRIQ9BWK5 157 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 LAMB1P07942 1786 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 TNNI2P48788 182 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 CACNB3P54284 484 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 RASGRF1Q13972 1273 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 SSH3Q8TE77 659 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 MAP3K11Q16584 847 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 ZBTB22O15209 634 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 MS4A1P11836 297 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 TEPSINQ96N21 525 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 GORABQ5T7V8 394 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 RNF186Q9NXI6 227 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 TRPA1O75762 1119 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 CAPN15O75808 1086 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 ABCF2Q9UG63 623 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG13-202ENST00000395549 SPRYD7Q5W111 196 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG13-202ENST00000395549 CEP85Q6P2H3 762 aa20.26■□□□□ 0.83
ATG13-202ENST00000395549 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ATG13-202ENST00000395549 TNNI3KQ59H18 835 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG13-202ENST00000395549 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG13-202ENST00000395549 FAM83AQ86UY5 434 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG13-202ENST00000395549 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ATG13-202ENST00000395549 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG13-202ENST00000395549 DOCK2Q92608 1830 aa20.25■□□□□ 0.83
ATG13-202ENST00000395549 UNCXA6NJT0 531 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG13-202ENST00000395549 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms