RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 LCA5Q86VQ0 697 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 ELP1O95163 1332 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 LMNB2Q03252 620 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 EID1Q9Y6B2 187 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC69A6NI79 296 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 CLTAP09496 248 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRT83P78385 493 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 IQCA1Q86XH1 822 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 IFT20Q8IY31 132 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 NRBF2Q96F24 287 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 POLE3Q9NRF9 147 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 MCTP2Q6DN12 878 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 CROCCP2Q86T23 111 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 NBPF3Q9H094 633 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 SSFA2P28290 1259 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 BLVRAP53004 296 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 ELF2Q15723 593 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 ESRRGP62508 458 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 CALCOCO2Q13137 446 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 FSD1Q9BTV5 496 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 SMIM23A6NLE4 172 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 RAD21O60216 631 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 E2F4Q16254 413 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 UBAC1Q9BSL1 405 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 DRC3Q9H069 523 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 ATG3Q9NT62 314 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 ATP2B1P20020 1258 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF521Q96K83 1311 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRT75O95678 551 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC159P0C7I6 412 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC26Q8TAB7 109 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 GNAI2P04899 355 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 IFT81Q8WYA0 676 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 A0A1W2PP64 1363 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 SEPT2Q15019 361 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 WASHC4Q2M389 1173 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 TNNQ9UQP3 1299 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 RIPK4P57078 832 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 FAM71BQ8TC56 605 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMEM232C9JQI7 657 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 LIG3P49916 1009 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 POLE2P56282 527 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 NUDCD3Q8IVD9 361 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC63Q8NA47 563 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 STX6O43752 255 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 INPP1P49441 399 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 FAM210AQ96ND0 272 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYOM2P54296 1465 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 ARHGEF9O43307 516 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPP1R7Q15435 360 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 FOXO3O43524 673 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 CNGA1P29973 690 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 PSMD2Q13200 908 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 BRD3Q15059 726 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRZ1-201ENST00000393386 ACEP12821 1306 aa6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 153.2 ms