RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391065.2

U3.49-201, humanhuman

BASIC

Gene U3, Length 214 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3.49-201ENST00000391065 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.72□□□□□ -0.05
U3.49-201ENST00000391065 ERO1AQ96HE7 468 aa14.72□□□□□ -0.05
U3.49-201ENST00000391065 ELP3Q9H9T3 547 aa14.72□□□□□ -0.05
U3.49-201ENST00000391065 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.71□□□□□ -0.05
U3.49-201ENST00000391065 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.71□□□□□ -0.05
U3.49-201ENST00000391065 OPTNQ96CV9 577 aa14.71□□□□□ -0.05
U3.49-201ENST00000391065 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.71□□□□□ -0.05
U3.49-201ENST00000391065 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.7□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 CRKP46108 304 aa14.7□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 MAP3K9P80192 1104 aa14.7□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 SP3Q02447 781 aa14.7□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.7□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 ARMC5Q96C12 935 aa14.7□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.69□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 LRRC24Q50LG9 513 aa14.69□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.69□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.69□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 MRIQ9BWK5 157 aa14.69□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 EFCC1Q9HA90 598 aa14.69□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 VGLL4Q14135 290 aa14.68□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 BCAMP50895 628 aa14.67□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 GTF2A2P52657 109 aa14.67□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.67□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 ZNF521Q96K83 1311 aa14.66□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 HTTP42858 3142 aa14.66□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 OTOFQ9HC10 1997 aa14.66□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.66□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 ANP32CO43423 234 aa14.66□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 PDE8BO95263 885 aa14.66□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 TNNI2P48788 182 aa14.66□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 CACNB3P54284 484 aa14.66□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 CCL15Q16663 113 aa14.66□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.66□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.66□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.65□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 FGFR2P21802 821 aa14.65□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.65□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 METTL24Q5JXM2 366 aa14.65□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.65□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 VPS37DQ86XT2 251 aa14.65□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.65□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 TEKT1Q969V4 418 aa14.65□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 OTUD5Q96G74 571 aa14.65□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 USP44Q9H0E7 712 aa14.65□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.65□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 CSADQ9Y600 493 aa14.65□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.65□□□□□ -0.06
U3.49-201ENST00000391065 FAM83AQ86UY5 434 aa14.64□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 ERO1BQ86YB8 467 aa14.64□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.64□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 GCC1Q96CN9 775 aa14.64□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 ZNF333Q96JL9 665 aa14.64□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 BTBD19C9JJ37 291 aa14.63□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 IRF6O14896 467 aa14.63□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 TLR2O60603 784 aa14.63□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.63□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.63□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.63□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.63□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 KIF16BQ96L93 1317 aa14.63□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 CETPP11597 493 aa14.62□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 ARHGEF6Q15052 776 aa14.62□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 WRNIP1Q96S55 665 aa14.62□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.61□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa14.61□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 PTPRCP08575 1304 aa14.61□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 PPIL2Q13356 520 aa14.6□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 SNAPC2Q13487 334 aa14.6□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.6□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.6□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.6□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 NBPF11Q86T75 865 aa14.6□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.6□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 HOOK2Q96ED9 719 aa14.6□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.6□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 MAST3O60307 1309 aa14.6□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 EYA2O00167 538 aa14.59□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 INPP5BP32019 993 aa14.59□□□□□ -0.07
U3.49-201ENST00000391065 PPATQ06203 517 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms