RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375150.6

PRRT1-202, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,726 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-202ENST00000375150 NFKBIEO00221 500 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-202ENST00000375150 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-202ENST00000375150 SCN9AQ15858 1988 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-202ENST00000375150 M0R2C6 588 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-202ENST00000375150 CYP7A1P22680 504 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-202ENST00000375150 MECOMQ03112 1051 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-202ENST00000375150 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-202ENST00000375150 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-202ENST00000375150 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-202ENST00000375150 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT1-202ENST00000375150 MCCP23508 829 aa22.7■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 GSTO1P78417 241 aa22.7■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.7■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 NIM1KQ8IY84 436 aa22.7■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 PSME4Q14997 1843 aa22.69■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 AIDAQ96BJ3 306 aa22.69■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 USP17L3A6NCW0 530 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 USP17L4A6NCW7 530 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 GPAA1O43292 621 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 PTH1RQ03431 593 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 SLF2Q8IX21 1173 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF384Q8TF68 577 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 JDP2Q8WYK2 163 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 COL4A5P29400 1685 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 LDHCP07864 332 aa22.66■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 MAP4K1Q92918 833 aa22.66■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.66■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.66■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.66■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 YDJCA8MPS7 323 aa22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 MBD4O95243 580 aa22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 GRIK5Q16478 980 aa22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 DACT2Q5SW24 774 aa22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 RASSF7Q02833 373 aa22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 CERS5Q8N5B7 392 aa22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.65■■□□□ 1.22
PRRT1-202ENST00000375150 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 GNAT2P19087 354 aa22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 HSPA4P34932 840 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 VPS53Q5VIR6 699 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 MXD3Q9BW11 206 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 ARMT1Q9H993 441 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 CERS3Q8IU89 383 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 LCORLQ8N3X6 602 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 RAD17O75943 681 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 BAG3O95817 575 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 ANAPC15P60006 121 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 RNF20Q5VTR2 975 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 F8W031 263 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.6■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 GAKO14976 1311 aa22.6■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 APPP05067 770 aa22.6■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 NECTIN1Q15223 517 aa22.6■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 PSMD14O00487 310 aa22.59■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 LMNB1P20700 586 aa22.59■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.59■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.59■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 FOXP2O15409 715 aa22.58■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 TNIP1Q15025 636 aa22.58■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.58■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.58■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 TEKT1Q969V4 418 aa22.58■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PRRT1-202ENST00000375150 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.57■■□□□ 1.2
PRRT1-202ENST00000375150 PLCG2P16885 1265 aa22.57■■□□□ 1.2
PRRT1-202ENST00000375150 PPP4CP60510 307 aa22.57■■□□□ 1.2
PRRT1-202ENST00000375150 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PRRT1-202ENST00000375150 CXCL9Q07325 125 aa22.57■■□□□ 1.2
PRRT1-202ENST00000375150 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.57■■□□□ 1.2
PRRT1-202ENST00000375150 MRIQ9BWK5 157 aa22.57■■□□□ 1.2
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