RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CPDO75976 1380 aa8.06□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GJA8P48165 433 aa8.05□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAB15P59190 212 aa8.05□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SERINC3Q13530 473 aa8.05□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.05□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.05□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLIN1O60240 522 aa8.05□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.05□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.05□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.05□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPG7Q9UQ90 795 aa8.05□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF521Q96K83 1311 aa8.05□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UTRNP46939 3433 aa8.05□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 APLP1P51693 650 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TEFQ10587 303 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PAK2Q13177 524 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AMOTQ4VCS5 1084 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FOXJ1Q92949 421 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LGR6Q9HBX8 967 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GGT7Q9UJ14 662 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AK5Q9Y6K8 562 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RGPD5Q99666 1765 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KDRP35968 1356 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OPLAHO14841 1288 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GNAI1P63096 354 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CBLBQ13191 982 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PI16Q6UXB8 463 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EXOC8Q8IYI6 725 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GJD3Q8N144 294 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TSPYL4Q9UJ04 414 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IL2RBP14784 551 aa8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNF20Q5VTR2 975 aa8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COPRSQ9NQ92 184 aa8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GABBR1Q9UBS5 961 aa8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP21Q9UK80 565 aa8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FGD1P98174 961 aa8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLEKHG6Q3KR16 790 aa8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IL17REQ8NFR9 667 aa8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MBIPQ9NS73 344 aa8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KAT6BQ8WYB5 2073 aa8.02□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa8.02□□□□□ -1.12
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BCAR3O75815 825 aa8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AKAP4Q5JQC9 854 aa8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAP3K5Q99683 1374 aa8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRT24Q2M2I5 525 aa8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SOGA3Q5TF21 947 aa8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IFNL2Q8IZJ0 200 aa8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SERTAD1Q9UHV2 236 aa8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP54Q70EL1 1684 aa8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MMP16P51512 607 aa8.01□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A6NHS1 94 aa8.01□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EXOC5O00471 708 aa8.01□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.01□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa8.01□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ABCA3Q99758 1704 aa8.01□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BCL9LQ86UU0 1499 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BTBD11A6QL63 1104 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ENPP3O14638 875 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CYP27B1O15528 508 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNMTO43148 476 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HRO43593 1189 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RXRBP28702 533 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PBX2P40425 430 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LINC01559Q495D7 138 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UNC5CLQ8IV45 518 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TSPYL6Q8N831 410 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC10A4Q96EP9 437 aa8□□□□□ -1.13
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