RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 USP6P35125 1406 aa23.61■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 NLRP1Q9C000 1473 aa23.61■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 KIAA0754O94854 1291 aa23.61■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 WDR78Q5VTH9 848 aa23.61■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 RIMBP2O15034 1052 aa23.61■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.61■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 PTGS1P23219 599 aa23.61■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 CETN2P41208 172 aa23.61■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 SYCP3Q8IZU3 236 aa23.61■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 AKR1B10O60218 316 aa23.6■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.6■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 ERICH4A6NGS2 130 aa23.6■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.6■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 CNBD1Q8NA66 436 aa23.6■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 TRAF1Q13077 416 aa23.59■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.59■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 LIG1P18858 919 aa23.59■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 STX17P56962 302 aa23.59■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 IFNKQ9P0W0 207 aa23.59■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 DNAI1Q9UI46 699 aa23.59■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.59■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.59■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 ELP1O95163 1332 aa23.59■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 TET3O43151 1660 aa23.59■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.58■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 OGFOD1Q8N543 542 aa23.58■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 LMBRD1Q9NUN5 540 aa23.58■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 ZNF853P0CG23 659 aa23.58■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 ANO1Q5XXA6 986 aa23.58■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 POTEB2H3BUK9 544 aa23.58■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 GNA11P29992 359 aa23.58■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 TNNI2P48788 182 aa23.58■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 PALD1Q9ULE6 856 aa23.58■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 DEXIO95424 95 aa23.58■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.58■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 SCLT1Q96NL6 688 aa23.58■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 SSH2Q76I76 1423 aa23.58■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 DESP17661 470 aa23.57■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 USP8P40818 1118 aa23.57■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.57■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 PTH1RQ03431 593 aa23.57■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.57■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.57■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.57■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.57■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.57■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 SPATA5Q8NB90 893 aa23.57■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 JADE2Q9NQC1 790 aa23.57■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 ABCC3O15438 1527 aa23.57■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 A0A0D9SFI3 127 aa23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 JAK2O60674 1132 aa23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 BRD1O95696 1058 aa23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 IQUBQ8NA54 791 aa23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 KRT79Q5XKE5 535 aa23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 PRDM1O75626 825 aa23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 EHBP1Q8NDI1 1231 aa23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 TEX11Q8IYF3 940 aa23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 ZNF174Q15697 407 aa23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 ME3Q16798 604 aa23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 FBXO3Q9UK99 471 aa23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.56■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 ZNF445P59923 1031 aa23.55■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 PROSER3Q2NL68 480 aa23.55■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 E7EWF7 191 aa23.55■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 CLSTN2Q9H4D0 955 aa23.55■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 UFL1O94874 794 aa23.55■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 CHMP4BP1P59074 171 aa23.55■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.54■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 TTC6Q86TZ1 520 aa23.54■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 PAF1Q8N7H5 531 aa23.54■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.54■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 SPAG5Q96R06 1193 aa23.54■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 EYA3Q99504 573 aa23.54■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 MYL10Q9BUA6 226 aa23.54■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 MYL5Q02045 173 aa23.53■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.53■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 PLIN2Q99541 437 aa23.53■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 MMRN2Q9H8L6 949 aa23.52■■□□□ 1.36
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