RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 MICU3Q86XE3 530 aa22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 KCNQ2O43526 872 aa22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 FSIP1Q8NA03 581 aa22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 SPATA5Q8NB90 893 aa22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 PHKBQ93100 1093 aa22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 ARMT1Q9H993 441 aa22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 A0A1B0GVL5 298 aa22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 LPIN2Q92539 896 aa22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 PRKAB2O43741 272 aa22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 SIK1P57059 783 aa22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 NEDD4P46934 1319 aa22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 MBD4O95243 580 aa22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 DRC7Q8IY82 874 aa22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.66■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 KIF28PB7ZC32 967 aa22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 TRIM5Q9C035 493 aa22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 TOMM22Q9NS69 142 aa22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.65■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.64■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 PTGS1P23219 599 aa22.64■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 EVCP57679 992 aa22.64■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 TICAM2Q86XR7 235 aa22.64■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.64■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 FGFR2P21802 821 aa22.64■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.64■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 SLC5A1P13866 664 aa22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 UBE3CQ15386 1083 aa22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 CDC27P30260 824 aa22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 KINO60870 393 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 UQCRHP07919 91 aa22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 STK38Q15208 465 aa22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 NAPBQ9H115 298 aa22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.62■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 CAMTA2O94983 1202 aa22.61■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.61■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.61■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 ABCC12Q96J65 1359 aa22.61■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 NDUFA8P51970 172 aa22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 LRMPQ12912 555 aa22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 FBXL16Q8N461 479 aa22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 ABCF2Q9UG63 623 aa22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 SMIM22K7EJ46 135 aa22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 MAP3K12Q12852 859 aa22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 APOA5Q6Q788 366 aa22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 LCORLQ8N3X6 602 aa22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 PIP4K2BP78356 416 aa22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 SDF4Q9BRK5 362 aa22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3-201ENST00000343028 ALG1Q9BT22 464 aa22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms