RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS2-201ENST00000329078 GOLGA8FQ08AF8 430 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS2-201ENST00000329078 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS2-201ENST00000329078 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS2-201ENST00000329078 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS2-201ENST00000329078 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SPNS2-201ENST00000329078 MTMR7Q9Y216 660 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS2-201ENST00000329078 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.02■■□□□ 1.28
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SPNS2-201ENST00000329078 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23■■□□□ 1.27
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SPNS2-201ENST00000329078 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.98■■□□□ 1.27
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SPNS2-201ENST00000329078 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
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SPNS2-201ENST00000329078 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS2-201ENST00000329078 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.93■■□□□ 1.26
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