RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319359.7

ELL3-201, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ELL3, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-201ENST00000319359 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.17■■□□□ 1.62
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ELL3-201ENST00000319359 HOMER1Q86YM7 354 aa25.17■■□□□ 1.62
ELL3-201ENST00000319359 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ELL3-201ENST00000319359 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.16■■□□□ 1.62
ELL3-201ENST00000319359 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
ELL3-201ENST00000319359 DNAI1Q9UI46 699 aa25.16■■□□□ 1.62
ELL3-201ENST00000319359 CPLX1O14810 134 aa25.16■■□□□ 1.62
ELL3-201ENST00000319359 CHRNA2Q15822 529 aa25.16■■□□□ 1.62
ELL3-201ENST00000319359 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.16■■□□□ 1.62
ELL3-201ENST00000319359 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.15■■□□□ 1.62
ELL3-201ENST00000319359 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
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ELL3-201ENST00000319359 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa25.15■■□□□ 1.62
ELL3-201ENST00000319359 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ELL3-201ENST00000319359 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
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ELL3-201ENST00000319359 ERICH4A6NGS2 130 aa25.15■■□□□ 1.62
ELL3-201ENST00000319359 TMEM232C9JQI7 657 aa25.15■■□□□ 1.62
ELL3-201ENST00000319359 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ELL3-201ENST00000319359 A1BGP04217 495 aa25.15■■□□□ 1.62
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ELL3-201ENST00000319359 CLIC6Q96NY7 704 aa25.13■■□□□ 1.61
ELL3-201ENST00000319359 GPR108Q9NPR9 543 aa25.13■■□□□ 1.61
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ELL3-201ENST00000319359 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.12■■□□□ 1.61
ELL3-201ENST00000319359 EPC1Q9H2F5 836 aa25.12■■□□□ 1.61
ELL3-201ENST00000319359 FHOD1Q9Y613 1164 aa25.12■■□□□ 1.61
ELL3-201ENST00000319359 ZAP70P43403 619 aa25.12■■□□□ 1.61
ELL3-201ENST00000319359 SHC4Q6S5L8 630 aa25.12■■□□□ 1.61
ELL3-201ENST00000319359 BRAPQ7Z569 592 aa25.12■■□□□ 1.61
ELL3-201ENST00000319359 SENP2Q9HC62 589 aa25.12■■□□□ 1.61
ELL3-201ENST00000319359 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.11■■□□□ 1.61
ELL3-201ENST00000319359 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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ELL3-201ENST00000319359 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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ELL3-201ENST00000319359 TRIM65Q6PJ69 517 aa25.11■■□□□ 1.61
ELL3-201ENST00000319359 XAGE2Q96GT9 111 aa25.11■■□□□ 1.61
ELL3-201ENST00000319359 SERPINC1P01008 464 aa25.1■■□□□ 1.61
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ELL3-201ENST00000319359 ZNF213O14771 459 aa25.07■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 IKBKBO14920 756 aa25.07■■□□□ 1.6
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ELL3-201ENST00000319359 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.07■■□□□ 1.6
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ELL3-201ENST00000319359 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
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ELL3-201ENST00000319359 INCENPQ9NQS7 918 aa25.07■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 INTS13Q9NVM9 706 aa25.07■■□□□ 1.6
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ELL3-201ENST00000319359 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 BMP6P22004 513 aa25.05■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 KCNJ6P48051 423 aa25.05■■□□□ 1.6
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ELL3-201ENST00000319359 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.04■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 NRDCO43847 1150 aa25.04■■□□□ 1.6
ELL3-201ENST00000319359 CIAO1O76071 339 aa25.04■■□□□ 1.6
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