RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318074.9

SYTL1-201, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYTL1, Length 1,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-201ENST00000318074 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.21■■□□□ 1.31
SYTL1-201ENST00000318074 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.21■■□□□ 1.31
SYTL1-201ENST00000318074 USP26Q9BXU7 913 aa23.2■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.2■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.2■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.2■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 M0R2C6 588 aa23.2■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.2■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 AIDAQ96BJ3 306 aa23.2■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.2■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.2■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 RASSF7Q02833 373 aa23.19■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 YDJCA8MPS7 323 aa23.18■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 GSTO1P78417 241 aa23.18■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 GPAA1O43292 621 aa23.18■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 GRIK5Q16478 980 aa23.18■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 DACT2Q5SW24 774 aa23.18■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF384Q8TF68 577 aa23.18■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 DOCK2Q92608 1830 aa23.17■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.17■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.17■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 MXD3Q9BW11 206 aa23.17■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.17■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.16■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 SLF2Q8IX21 1173 aa23.16■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 CERS5Q8N5B7 392 aa23.16■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.16■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 LDHCP07864 332 aa23.16■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 PTH1RQ03431 593 aa23.16■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.15■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 F8W031 263 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 RAD17O75943 681 aa23.15■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 MBD4O95243 580 aa23.15■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 MCCP23508 829 aa23.15■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.14■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 MAP4K1Q92918 833 aa23.14■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.14■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
SYTL1-201ENST00000318074 CHD4Q14839 1912 aa23.14■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 ARMT1Q9H993 441 aa23.14■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 COL4A5P29400 1685 aa23.13■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 VPS53Q5VIR6 699 aa23.13■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.13■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 MYH7P12883 1935 aa23.13■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 LMNB1P20700 586 aa23.12■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.12■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.12■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 PSMD14O00487 310 aa23.12■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 BAG3O95817 575 aa23.12■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 APPP05067 770 aa23.12■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 GNAT2P19087 354 aa23.12■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 GPR162Q16538 588 aa23.12■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 LCORLQ8N3X6 602 aa23.12■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.11■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 PRELPP51888 382 aa23.11■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 CXCL9Q07325 125 aa23.1■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 TNIP1Q15025 636 aa23.1■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 HSPA4P34932 840 aa23.1■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.1■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.1■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 SCN9AQ15858 1988 aa23.09■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 SCNN1DP51172 638 aa23.09■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 TEKT1Q969V4 418 aa23.09■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 RNF20Q5VTR2 975 aa23.08■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 CERS3Q8IU89 383 aa23.08■■□□□ 1.29
SYTL1-201ENST00000318074 FZD9O00144 591 aa23.08■■□□□ 1.28
SYTL1-201ENST00000318074 NECTIN1Q15223 517 aa23.08■■□□□ 1.28
SYTL1-201ENST00000318074 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.08■■□□□ 1.28
SYTL1-201ENST00000318074 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.08■■□□□ 1.28
SYTL1-201ENST00000318074 GAKO14976 1311 aa23.07■■□□□ 1.28
SYTL1-201ENST00000318074 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.07■■□□□ 1.28
SYTL1-201ENST00000318074 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.07■■□□□ 1.28
SYTL1-201ENST00000318074 BTDP43251 543 aa23.07■■□□□ 1.28
SYTL1-201ENST00000318074 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.07■■□□□ 1.28
SYTL1-201ENST00000318074 OGFOD1Q8N543 542 aa23.07■■□□□ 1.28
SYTL1-201ENST00000318074 MRIQ9BWK5 157 aa23.07■■□□□ 1.28
SYTL1-201ENST00000318074 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SYTL1-201ENST00000318074 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SYTL1-201ENST00000318074 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.07■■□□□ 1.28
SYTL1-201ENST00000318074 FOXP2O15409 715 aa23.06■■□□□ 1.28
SYTL1-201ENST00000318074 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms