RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317040.11

MVB12A-201, Transcript of multivesicular body subunit 12A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MVB12A, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12A-201ENST00000317040 SUCLG2Q96I99 432 aa22.13■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 FANCGO15287 622 aa22.12■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 CMA1P23946 247 aa22.12■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 UBASH3AP57075 661 aa22.12■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 MYL5Q02045 173 aa22.12■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 KAZALD1Q96I82 304 aa22.12■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 NGLY1Q96IV0 654 aa22.12■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.12■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 ADAM21Q9UKJ8 722 aa22.12■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 TXLNAP40222 546 aa22.12■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.12■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.12■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.12■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 NOP2P46087 812 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 TUBB2AQ13885 445 aa22.11■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 TMEM139Q8IV31 216 aa22.11■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.11■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.11■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.11■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 SPTLC2O15270 562 aa22.11■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 STX10O60499 249 aa22.11■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF202O95125 648 aa22.11■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.1■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.1■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.09■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 USP5P45974 858 aa22.09■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.09■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.09■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 BTG4Q9NY30 223 aa22.09■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 SERPINC1P01008 464 aa22.08■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 APOBRQ0VD83 1088 aa22.08■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 IP6K1Q92551 441 aa22.08■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 KIFC2Q96AC6 838 aa22.08■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 PALLDQ8WX93 1383 aa22.08■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 HAUS7Q99871 368 aa22.08■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 COPRSQ9NQ92 184 aa22.08■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.08■■□□□ 1.13
MVB12A-201ENST00000317040 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.07■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 GNG11P61952 73 aa22.07■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 FBXW7Q969H0 707 aa22.07■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.07■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 TUBBP07437 444 aa22.07■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 RAB21Q9UL25 225 aa22.07■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 LTN1O94822 1766 aa22.07■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 LMAN1P49257 510 aa22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 CFAP100Q494V2 611 aa22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 SIL1Q9H173 461 aa22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 BTBD11A6QL63 1104 aa22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 PFKFB1P16118 471 aa22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 TEFQ10587 303 aa22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 HDXQ7Z353 690 aa22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 C10orf67Q8IYJ2 551 aa22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 CLIC4Q9Y696 253 aa22.06■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.05■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 ERLIN1O75477 346 aa22.05■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 ATP1A3P13637 1013 aa22.05■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 FDPSP14324 419 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.05■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.05■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 AFF2P51816 1311 aa22.05■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 A0A1B0GUL7 405 aa22.04■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.04■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 MSANTD4Q8NCY6 345 aa22.04■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 WDR24Q96S15 920 aa22.04■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.04■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 SLIT2O94813 1529 aa22.04■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 COL18A1P39060 1754 aa22.04■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 H3BQF6 201 aa22.04■■□□□ 1.12
MVB12A-201ENST00000317040 ANXA1P04083 346 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms