RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311083.9

CSRP2-201, Transcript of cysteine and glycine rich protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSRP2, Length 943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2-201ENST00000311083 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CSRP2-201ENST00000311083 SERPINA10Q9UK55 444 aa16.04■□□□□ 0.16
CSRP2-201ENST00000311083 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CSRP2-201ENST00000311083 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CSRP2-201ENST00000311083 LPIN2Q92539 896 aa16.03■□□□□ 0.16
CSRP2-201ENST00000311083 SAGE1Q9NXZ1 904 aa16.03■□□□□ 0.16
CSRP2-201ENST00000311083 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa16.03■□□□□ 0.16
CSRP2-201ENST00000311083 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CSRP2-201ENST00000311083 SSC5DA1L4H1 1573 aa16.02■□□□□ 0.16
CSRP2-201ENST00000311083 TCP10L2B9ZVM9 353 aa16.02■□□□□ 0.16
CSRP2-201ENST00000311083 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.02■□□□□ 0.16
CSRP2-201ENST00000311083 LDLRAD1Q5T700 205 aa16.02■□□□□ 0.16
CSRP2-201ENST00000311083 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa16.02■□□□□ 0.16
CSRP2-201ENST00000311083 CLUAP1Q96AJ1 413 aa16.02■□□□□ 0.16
CSRP2-201ENST00000311083 MCOLN1Q9GZU1 580 aa16.02■□□□□ 0.16
CSRP2-201ENST00000311083 CEP126Q9P2H0 1117 aa16.02■□□□□ 0.16
CSRP2-201ENST00000311083 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.02■□□□□ 0.16
CSRP2-201ENST00000311083 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 CIAO1O76071 339 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 TRIM27P14373 513 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 DGKZQ13574 1117 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 CDAN1Q8IWY9 1227 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 SLC10A4Q96EP9 437 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 CLMNQ96JQ2 1002 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 HDAC5Q9UQL6 1122 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 ARAP2Q8WZ64 1704 aa16.01■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 CCDC85CA6NKD9 419 aa16■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 TBC1D8O95759 1140 aa16■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 GNAI3P08754 354 aa16■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 CACNB3P54284 484 aa16■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 ATP2B3Q16720 1220 aa16■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa16■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 USP2O75604 605 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 IL15P40933 162 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 MAP3K11Q16584 847 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 SPRYD7Q5W111 196 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 TEKT1Q969V4 418 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 TMEM39BQ9GZU3 492 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 FBXO3Q9UK99 471 aa15.99■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 SRGAP3O43295 1099 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 ADORA1P30542 326 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 TM4SF4P48230 202 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 TNFAIP1Q13829 316 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 COPRSQ9NQ92 184 aa15.98■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 PHKA1P46020 1223 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 IREB2P48200 963 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 WDR66Q8TBY9 1149 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 WNK4Q96J92 1243 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 ZDHHC15Q96MV8 337 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 TEPSINQ96N21 525 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 MYH13Q9UKX3 1938 aa15.97■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 TNNI2P48788 182 aa15.96■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 TIMM10P62072 90 aa15.96■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 SREBF2Q12772 1141 aa15.96■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 TMEM57Q8N5G2 664 aa15.96■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa15.96■□□□□ 0.15
CSRP2-201ENST00000311083 MAST3O60307 1309 aa15.95■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 GNAI2P04899 355 aa15.95■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 PRDX5P30044 214 aa15.95■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 GJA5P36382 358 aa15.95■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 TFCP2Q12800 502 aa15.95■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa15.95■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 MRIQ9BWK5 157 aa15.95■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa15.95■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 ELP3Q9H9T3 547 aa15.95■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa15.94■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 MTX1Q13505 466 aa15.94■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 DIXDC1Q155Q3 683 aa15.94■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 CCDC102BQ68D86 513 aa15.94■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 HHIPL2Q6UWX4 724 aa15.94■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa15.94■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 TMOD2Q9NZR1 351 aa15.94■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 LDHBP07195 334 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 DENND2AQ9ULE3 1009 aa15.93■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 A0A1B0GUL7 405 aa15.92■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 UNCXA6NJT0 531 aa15.92■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 GPR25O00155 361 aa15.92■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 IFNL1Q8IU54 200 aa15.92■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 OPTNQ96CV9 577 aa15.92■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 XAGE2Q96GT9 111 aa15.92■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 NEUROD6Q96NK8 337 aa15.92■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa15.92■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 OTOFQ9HC10 1997 aa15.92■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 INHBEP58166 350 aa15.91■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 MAP3K9P80192 1104 aa15.91■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 TCP10Q12799 353 aa15.91■□□□□ 0.14
CSRP2-201ENST00000311083 RASGRF1Q13972 1273 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms