RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 SETDB1Q15047 1291 aa27.21■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 RASSF4Q9H2L5 321 aa27.21■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 AFAP1L1Q8TED9 768 aa27.2■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 SPDYE3A6NKU9 549 aa27.2■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 HS2ST1Q7LGA3 356 aa27.2■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 POLKQ9UBT6 870 aa27.2■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 IGSF22Q8N9C0 903 aa27.19■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 HELLSQ9NRZ9 838 aa27.19■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.19■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 VWA3AA6NCI4 1184 aa27.19■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT24Q2M2I5 525 aa27.19■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 GNA11P29992 359 aa27.19■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC16Q8NEE8 873 aa27.19■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 CLSTN2Q9H4D0 955 aa27.19■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 CALCOCO2Q13137 446 aa27.18■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 RAPGEF1Q13905 1077 aa27.18■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 MTUS1Q9ULD2 1270 aa27.18■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF804AQ7Z570 1209 aa27.18■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 MCM9Q9NXL9 1143 aa27.18■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
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GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF354CQ86Y25 554 aa27.17■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM14Q14142 442 aa27.17■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 SEL1L2Q5TEA6 688 aa27.17■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa27.17■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 SETDB2Q96T68 719 aa27.17■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC26Q8TAB7 109 aa27.16■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 PIK3C2GO75747 1445 aa27.16■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 FANCAO15360 1455 aa27.16■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.16■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP26C1Q6V0L0 522 aa27.16■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP6V1AP38606 617 aa27.15■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF75DP51815 510 aa27.15■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 CEP83Q9Y592 693 aa27.15■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 TUBB2AQ13885 445 aa27.15■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 SV2BQ7L1I2 683 aa27.15■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 NLRP3Q96P20 1036 aa27.15■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 TUBB2BQ9BVA1 445 aa27.15■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP3K5Q99683 1374 aa27.15■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 GBP6Q6ZN66 633 aa27.15■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 ANAPC4Q9UJX5 808 aa27.15■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.15■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC27A2O14975 620 aa27.15■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa27.15■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 TCHPQ9BT92 498 aa27.15■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.15■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1B0GUL7 405 aa27.14■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 PLS1Q14651 629 aa27.14■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 NGLY1Q96IV0 654 aa27.14■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
GNPTAB-201ENST00000299314 DPH6Q7L8W6 267 aa27.14■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 JAKMIP2Q96AA8 810 aa27.14■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS16Q9H269 839 aa27.14■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 STIM2Q9P246 746 aa27.14■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 ANO1Q5XXA6 986 aa27.13■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 CFAP57Q96MR6 1250 aa27.13■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 FANCCQ00597 558 aa27.13■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 CBX8Q9HC52 389 aa27.13■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 GRIN2AQ12879 1464 aa27.13■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMC4P43686 418 aa27.13■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 HPDP32754 393 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP7D1Q3KQU3 841 aa27.13■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa27.13■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 RPL13P26373 211 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 RILPL1Q5EBL4 403 aa27.13■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM87AQ8NBN3 555 aa27.12■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNH3Q9ULD8 1083 aa27.12■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 SNX14Q9Y5W7 946 aa27.12■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R2P41236 205 aa27.12■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa27.12■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 AKNAD1Q5T1N1 836 aa27.12■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 C8orf74Q6P047 294 aa27.12■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC65Q8IXS2 484 aa27.12■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 FMNL3Q8IVF7 1028 aa27.12■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa27.11■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM212AQ96EL1 285 aa27.11■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 CARD6Q9BX69 1037 aa27.11■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 VIMP08670 466 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 PLCD1P51178 756 aa27.11■■□□□ 1.93
GNPTAB-201ENST00000299314 ELF2Q15723 593 aa27.11■■□□□ 1.93
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