RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.46■■□□□ 1.35
HPS6-201ENST00000299238 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HPS6-201ENST00000299238 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 NEK11Q8NG66 645 aa23.45■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.45■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 SCARF1Q14162 830 aa23.45■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 OSBP2Q969R2 916 aa23.45■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 GREM2Q9H772 168 aa23.45■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.44■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 EXOC5O00471 708 aa23.44■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 GYS2P54840 703 aa23.44■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.44■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.44■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa23.44■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 PTPDC1A2A3K4 754 aa23.44■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 ITGA6P23229 1130 aa23.44■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 CTSWP56202 376 aa23.44■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.44■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 GUCY1B3Q02153 619 aa23.43■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 TRIM66O15016 1216 aa23.43■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 FOXP2O15409 715 aa23.43■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 METTL24Q5JXM2 366 aa23.43■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 CBX8Q9HC52 389 aa23.43■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.42■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 CFAP45Q9UL16 551 aa23.42■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.42■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 ABCC12Q96J65 1359 aa23.42■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 CEP135Q66GS9 1140 aa23.42■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 EFCC1Q9HA90 598 aa23.42■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 ZAP70P43403 619 aa23.41■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.41■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 WASHC4Q2M389 1173 aa23.41■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 PI16Q6UXB8 463 aa23.41■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 DRC7Q8IY82 874 aa23.41■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 DNAJC25Q9H1X3 360 aa23.41■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.4■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.4■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 FBXL16Q8N461 479 aa23.4■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 A0A087WWV3 80 aa23.4■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 USP27XA6NNY8 438 aa23.4■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.4■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 LCMT1Q9UIC8 334 aa23.4■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 HAND2P61296 217 aa23.39■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 C10orf67Q8IYJ2 551 aa23.39■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.39■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.39■■□□□ 1.34
HPS6-201ENST00000299238 EVCP57679 992 aa23.39■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.39■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 LRP5O75197 1615 aa23.38■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.38■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 RASSF4Q9H2L5 321 aa23.38■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 APPBP2Q92624 585 aa23.38■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 SLIT2O94813 1529 aa23.37■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.37■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.37■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 YY1AP1Q9H869 796 aa23.37■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 NRAPQ86VF7 1730 aa23.37■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 MCAMP43121 646 aa23.37■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.37■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 PDE8AO60658 829 aa23.36■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 PRR29P0C7W0 189 aa23.36■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 PSEN1P49768 467 aa23.36■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 ZNF165P49910 485 aa23.36■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 USP28Q96RU2 1077 aa23.36■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 FHOD1Q9Y613 1164 aa23.36■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 FDPSP14324 419 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 TRIM5Q9C035 493 aa23.35■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.35■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.35■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 FGAP02671 866 aa23.34■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.34■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.34■■□□□ 1.33
HPS6-201ENST00000299238 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms