RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 CLRN2A0PK11 232 aa30.72■■■□□ 2.51
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CXCL2-201ENST00000296031 SALL1Q9NSC2 1324 aa30.72■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 TEKT1Q969V4 418 aa30.71■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 DBNDD2Q9BQY9 259 aa30.71■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 TLL2Q9Y6L7 1015 aa30.71■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 APBB1O00213 710 aa30.7■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 DEFB115Q30KQ5 88 aa30.7■■■□□ 2.51
CXCL2-201ENST00000296031 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
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CXCL2-201ENST00000296031 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa30.69■■■□□ 2.5
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CXCL2-201ENST00000296031 TTC39AQ5SRH9 613 aa30.68■■■□□ 2.5
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CXCL2-201ENST00000296031 RHPN1Q8TCX5 695 aa30.68■■■□□ 2.5
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
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CXCL2-201ENST00000296031 HMG20BQ9P0W2 317 aa30.68■■■□□ 2.5
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CXCL2-201ENST00000296031 SPATA5Q8NB90 893 aa30.67■■■□□ 2.5
CXCL2-201ENST00000296031 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa30.67■■■□□ 2.5
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CXCL2-201ENST00000296031 HHIPL2Q6UWX4 724 aa30.66■■■□□ 2.5
CXCL2-201ENST00000296031 PI16Q6UXB8 463 aa30.66■■■□□ 2.5
CXCL2-201ENST00000296031 C2orf69Q8N8R5 385 aa30.66■■■□□ 2.5
CXCL2-201ENST00000296031 KIF1BPQ96EK5 621 aa30.66■■■□□ 2.5
CXCL2-201ENST00000296031 ZDHHC15Q96MV8 337 aa30.66■■■□□ 2.5
CXCL2-201ENST00000296031 CRBNQ96SW2 442 aa30.66■■■□□ 2.5
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
CXCL2-201ENST00000296031 ABCF2Q9UG63 623 aa30.66■■■□□ 2.5
CXCL2-201ENST00000296031 VEGFBP49765 207 aa30.65■■■□□ 2.5
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CXCL2-201ENST00000296031 DEFB129Q9H1M3 183 aa30.65■■■□□ 2.5
CXCL2-201ENST00000296031 MCAMP43121 646 aa30.64■■■□□ 2.5
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CXCL2-201ENST00000296031 JMYQ8N9B5 988 aa30.64■■■□□ 2.5
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CXCL2-201ENST00000296031 DIXDC1Q155Q3 683 aa30.63■■■□□ 2.49
CXCL2-201ENST00000296031 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
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CXCL2-201ENST00000296031 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
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CXCL2-201ENST00000296031 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa30.61■■■□□ 2.49
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CXCL2-201ENST00000296031 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
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CXCL2-201ENST00000296031 TCP10L2B9ZVM9 353 aa30.59■■■□□ 2.49
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CXCL2-201ENST00000296031 RASA3Q14644 834 aa30.59■■■□□ 2.49
CXCL2-201ENST00000296031 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa30.59■■■□□ 2.49
CXCL2-201ENST00000296031 ERICH6Q7L0X2 663 aa30.59■■■□□ 2.49
CXCL2-201ENST00000296031 TMOD2Q9NZR1 351 aa30.59■■■□□ 2.49
CXCL2-201ENST00000296031 ECE1P42892 770 aa30.58■■■□□ 2.49
CXCL2-201ENST00000296031 CACNB3P54284 484 aa30.58■■■□□ 2.49
CXCL2-201ENST00000296031 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
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CXCL2-201ENST00000296031 MOB2Q70IA6 237 aa30.57■■■□□ 2.48
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CXCL2-201ENST00000296031 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa30.54■■■□□ 2.48
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CXCL2-201ENST00000296031 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
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