RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 CTAGE5O15320 804 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 STX17P56962 302 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 NLRP10Q86W26 655 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 MNS1Q8NEH6 495 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 CLIC6Q96NY7 704 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 IGSF3O75054 1194 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 MCAMP43121 646 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 STAMQ92783 540 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 KRT40Q6A162 431 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 SPATA5Q8NB90 893 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 STX8Q9UNK0 236 aa14.5□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 TSPY2A6NKD2 308 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 IQCA1Q86XH1 822 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 ATG3Q9NT62 314 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF609O15014 1411 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.49□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 PDE8BO95263 885 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 NDUFA8P51970 172 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 ARID5BQ14865 1188 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 ANO1Q5XXA6 986 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 CABP5Q9NP86 173 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 ST3GAL1Q11201 340 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF75DP51815 510 aa14.48□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa14.47□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 F8W031 263 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 NLRP5P59047 1200 aa14.47□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 RESTQ13127 1097 aa14.47□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.47□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 LPIN2Q92539 896 aa14.47□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 DHX58Q96C10 678 aa14.47□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 PLIN2Q99541 437 aa14.47□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.47□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF202O95125 648 aa14.47□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa14.47□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF827Q17R98 1081 aa14.47□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.47□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 MEGF6O75095 1541 aa14.47□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.46□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.46□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 BTBD18B2RXH4 712 aa14.46□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 UBASH3AP57075 661 aa14.46□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.46□□□□□ -0.09
UBXN4-201ENST00000272638 SMTNL1A8MU46 457 aa14.46□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 WASF1Q92558 559 aa14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 GNPATO15228 680 aa14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 URI1O94763 535 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 TPM1P09493 284 aa14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 SUSD4Q5VX71 490 aa14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 SETDB2Q96T68 719 aa14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 PEAK1Q9H792 1746 aa14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 PNOCQ13519 176 aa14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 ESR2Q92731 530 aa14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 CEP135Q66GS9 1140 aa14.44□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.44□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 NLRP3Q96P20 1036 aa14.44□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.44□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.44□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 COBLO75128 1261 aa14.44□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF174Q15697 407 aa14.44□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.44□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.44□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 NCAPD2Q15021 1401 aa14.44□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.44□□□□□ -0.1
UBXN4-201ENST00000272638 C6orf229H3BNL8 230 aa14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms