RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 AOX1Q06278 1338 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 EFCAB8A8MWE9 144 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 TADA3O75528 432 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 CHMLP26374 656 aa25.34■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 CALRP27797 417 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 IRF6O14896 467 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 ZNF165P49910 485 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 FAM212AQ96EL1 285 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 KIF3CO14782 793 aa25.33■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 POTEAQ6S8J7 498 aa25.33■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 TADA2BQ86TJ2 420 aa25.33■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.33■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa25.33■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 TNMDQ9H2S6 317 aa25.33■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 FUT8Q9BYC5 575 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 BCL9O00512 1426 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 FOXR1Q6PIV2 292 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 IL25Q9H293 177 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 ARFGAP3Q9NP61 516 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 SASH1O94885 1247 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa25.3■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 KCNJ6P48051 423 aa25.3■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 GSDMDP57764 484 aa25.3■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 H3BQF6 201 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 CAMK4Q16566 473 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 RXRBP28702 533 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 SIL1Q9H173 461 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 USP8P40818 1118 aa25.28■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 C11orf91Q3C1V1 193 aa25.28■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 CKAP2LQ8IYA6 745 aa25.28■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 LIG1P18858 919 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.27■■□□□ 1.64
PITX1-201ENST00000265340 A0A087WZG4 1122 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 C21orf2O43822 256 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 CASP7P55210 303 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 FAM107BQ9H098 131 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 MAP9Q49MG5 647 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 JMYQ8N9B5 988 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.26■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 PPP2R5AQ15172 486 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC25Q9H1X3 360 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 CLSTN2Q9H4D0 955 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 MAP2K7O14733 419 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 SGSM2O43147 1006 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 ETF1P62495 437 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.25■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 SMC2O95347 1197 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 EVCP57679 992 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 AACSQ86V21 672 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 DNAI1Q9UI46 699 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 MTMR6Q9Y217 621 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 MNAT1P51948 309 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 IQCB1Q15051 598 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 STAG1Q8WVM7 1258 aa25.24■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 GORABQ5T7V8 394 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 ANO2Q9NQ90 1003 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 DACT1Q9NYF0 836 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 VPS18Q9P253 973 aa25.23■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.22■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 TTC6Q86TZ1 520 aa25.22■■□□□ 1.63
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms